除了面积太小以外，这一现象的形成也有其历史原因。厦门始筑于明朝洪武二十七年，厦门地处九龙江出海口，港阔水深，避风条件好，其海岸线长达234公里，12米深以上的深水海岸线有43公里，适于作为港口。18世纪初法国人霍尔德称其为“世界上最好的的港口之一”，清代《厦门志》也称其为“东南门户”。
起初厦门作为海防重地开始引起重视，明中后期在厦门驻扎官兵防备海盗，16世纪开始逐渐取代泉州和漳州作为东南地区海上交通枢纽，崇祯年间月港因海禁封闭，厦门正式取代其地位。
明朝因海禁迁徙至厦门的商民
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公元1646年清军攻入福建，福建本地的实力派—郑氏家族在郑成功的带领下坚持不懈的进行反清战争。郑成功以厦门、金门两地为根据地进行反清战争，但终究是“器械不备，粮饷不足”，为了扩充实力，郑成功在其家族原先经营贸易的基础上，以厦门为中心开拓了覆盖日本、东南亚的贸易网。
厦门鼓浪屿的郑成功雕像
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