虽然关于通古斯大爆炸的第一次探查就这样结束，但科学界对爆炸原因的研究却从此开始延续了近百年，提出了几十种猜想，始终没有一个准确的答案。
1945年，在广岛原子弹爆炸后，美国一位科学家则提出过一个假说——造成通古斯大爆炸的原因是核爆。
不得不说，从某些角度来看，这个假说并非没有道理，尤其是后续在居民口中的那些诡异现象，和核辐射引起的现象如出一辙。
但是很快，这个假说就得到了否认。原因很简单，有科学家测算了当初通古斯大爆炸的威力，得出的结论是大约相当于1000颗广岛原子弹爆炸。
要知道通古斯大爆炸发生在1908年，如果真是核爆，那当时俄罗斯的科技水平应该远远超过世界各国了，显然不太现实。
后续又有科学家根据通古斯大爆炸的威力提出了反物质说，根据他们的说法，引发爆炸的应该是0.5克的铁和0.5克的“反铁”。在计算中，它们相撞就足以产生威力远超广岛原子弹的爆炸。
可在对通古斯大爆炸中心区域的检测中，又没有发现反物质说最核心的伽马射线，因此这个推论也不成立。
在这之后的诸多猜想开始变得魔幻了起来，有干脆归结于外星人的，有认为是黑洞的，还有的人认为是特斯拉研发的秘密武器，通过雷电引起了大爆炸，并且还拿出了一个极其巧合的证据——在爆炸发生前夕，特斯拉在图书馆查找了人烟稀少的通古斯区域地理位置。
而真正被大多数人认可的，还要数彗星撞击说。在前苏联科学院院士彼得罗夫提出这一说法后，引起了许多科学家的讨论。
他认为通古斯大爆炸是由一颗雪团组成的彗星导致的，在自天空冲向地面时被蒸发殆尽，所以才没有找到任何残骸。
在一说法提出后，又有许多科学家为此增添了各种论据，使得它不断地完善。比如一位美国科学家在实验室中模拟了一块陨石在近地空中爆炸后，树木倒塌的现象，正好出现了通古斯大爆炸中的情况，中间的树木没有倒塌。
还有冲击波扬起的尘埃反射日光，才导致了当初接连几日天空中都亮如白昼的现象。
至于当地居民口中的辐射现象，则是彗星中的一些碎片含有放射性物质。
但在2013年一次相似的陨石高空爆炸事件后，这一推论也受到了否定。通过这起事件，科学家们计算出，如果是冰雪组成的陨石是不可能在低空爆炸的。
直到2020年，来自俄罗斯的一个研究团队对通古斯大爆炸给出的解释才算是给一切的猜想盖棺定论，也是目前科学家们最认可的答案。
