后来发生袁崇焕斩*守将毛文龙一事，虽然毛文龙有贪污军饷的嫌疑，可毕竟毛文龙是抗清将领，擅*边防将领是重罪，即便朱由检表面没有怪罪袁崇焕，可他的心里依旧对此耿耿于怀。
多疑的朱由检对我行我素的袁崇焕日益不满，在皇太极率领清兵绕道蒙古准备攻打京城的时候，没有经过从朱由检许可，袁崇焕就擅自率领军队回京救援。
各种复杂的事情和道不清的误会，让朱由检对袁崇焕下达了凌迟处死的决定。袁崇焕死后，明朝失去最后一道防火墙，直到1644年的那一天，朱由检下了生命中最后一份罪己诏，然后自缢身亡了。
令人悲哀的是，朱由检在最后时刻亲自鸣钟上殿，满朝文武无一人来，只剩下空荡荡的宫殿和孤独的朱由检。
参考资料：《明史》等
