皇命不可违，更何况是自己的皇爷爷，无论是自己的父亲明仁宗朱高炽在永乐二十二年（1424）即位，还是朱瞻基自己于洪熙元年（1425）即位，都无法改变孙氏只能做一个侧室的结局。孙氏但凡冲着朱瞻基发一下脾气，朱瞻基都会少些愧疚，可偏偏孙氏不吵不闹，接受现实，即便只能一辈子作嫔为妾，她也愿意待在朱瞻基的身边，陪伴他，守护他。两人相伴这么多年，情谊自然深厚，朱瞻基越是爱她，内心就越是愧疚。于是在自己登基之后，不仅延迟了二十几天才在压力之下正式立了胡善祥为皇后，同时立自己最深爱的孙氏为贵妃，最重要的是特地破格为她做了一枚金印。按照之前的宫廷礼制，皇后被册立以后，可以赐金册金印，贵妃以下则是有册无印。朱瞻基此举则是开了贵妃金印的先例，更是印证了孙氏在他心中无可撼动的地位。
宣德二年(1427)十一月，明宣宗朱瞻基迎来了自己的长子朱祁镇，这个孩子便是由他最爱的孙氏所生，反观高居后位上的胡善祥只生下了两个公主。朱瞻基废胡立孙的心思上升到了顶点，于是他毫不犹豫以胡皇后无子的理由召集大臣商议废后事宜。《胜朝彤史拾遗记》记载：“朕有一大事与卿等议，固出不得已，然亦决矣。朕三十无子，而中宫屡身不得育，顷且病。日者言中宫禄命必无子，今贵妃有子，当立为嗣。夫母以子贵，礼也。”
宣德三年（1428），胡善祥自请上疏辞去后位。由于张太后对胡善祥的怜爱和庇佑，明宣宗朱瞻基没有让大臣对其有任何的诬蔑和栽赃，准其退居长安宫，赐号“静慈法师”。《明史》言：“英宗法天立道仁明诚敬昭文宪武至德广孝睿皇帝，讳祁镇，宣宗长子也。母贵妃孙氏。生四月，立为皇太子，遂册贵妃为皇后。”
好景不长，宣德十年（1435），明宣宗朱瞻基病情日益加重，开始交待后事，正月崩于乾清宫。因皇太子朱祁镇年仅九岁，国家重务便由太皇太后张氏处置。张氏重用贤臣，治国有道，但历史就是这般波诡云谲，正统七年（1442），太皇太后张氏崩逝，明英宗朱祁镇所宠信的宦官王振开始兴风作浪。在瓦剌来犯多次以后，王振又煽动明英宗朱祁镇亲自北征，果不其然，在他们的肆意妄为之下，正统十四年（1449）明英宗朱祁镇于土木堡被俘，成为了明朝第一个当过俘虏的皇帝，随行五十多名的文官武将几乎全部战死沙场，数十万大军也几乎全军覆没。
瓦剌太师也先打着明英宗朱祁镇皇帝的名义招摇撞骗。孙氏虽为明英宗朱祁镇的亲生母亲，但是她明白自己更是大明朝的太后，于是寸步不让，并且同于谦等大臣商议以后，以“国不可一日无君”的理由立郕王朱祁钰为皇帝，遥尊被俘的明英宗朱祁镇为太上皇。
瓦剌太师也先被明朝此举激怒以后，直接南下攻打明朝首都北京。太后孙氏与于谦等一众大臣商议后拒绝南迁，打响了京师保卫战，正统十四年（1449）8月16日到11月8日，在以于谦为首的大臣努力之下，守住了北京城，瓦剌大军被迫退走。而后一直到景泰元年（1450）八月，瓦剌大军数次南下，都未能得逞，同年瓦剌无条件释放了明英宗朱祁镇，恢复了蒙古部与明朝的臣属关系。
孙氏受丈夫朱瞻基宠爱半生，也为他守住了明朝的大门，天顺六年（1462）九月初四日，孙氏去逝，终于可以去追寻她爱的、亦爱她的明宣宗朱瞻基，并与其合葬于景陵。
《明史纪事本末》中书，明宣宗：“贵妃孙氏，皇祖太宗选嫔于朕。十有余年，德义之茂，冠于后宫。”
