笔者在做魔芋的组织培养时，发现从野外采集回来的种球，即使表面消毒*菌做得再好，当切块后移植到培养基上，98%以上的魔芋组织会被魔芋组织本身携带的内生菌污染。后来，笔者采用高锰酸钾与甲醛（1∶2）联合在干燥皿中对魔芋球茎熏蒸1～2次后，再进行表面消毒、接种，发现所切块的球茎组织98%以上可以成功长出愈伤组织而不被污染。由此得到启发，笔者对大田种植的魔芋种芋也采取类似的操作策略，发现这种方式消毒的种芋种植到田间后，发病率大大降低。操作步骤见种芋贮藏章节中的药剂熏蒸方法。
当然，这种消毒方式虽然把魔芋球茎内的微生物绝大部分*灭，但土壤中依然会有病菌存在，这也会导致魔芋在生长期间发病。为了降低发病率，有的研究者想到用药袋或药膜包裹球茎，起到进一步保护效果。当种芋在田间萌动出芽生长时，药袋或药膜在土壤中对魔芋根际周围生长环境中的有害微生物有较强的抑制效果，从而起到保护效果。
药膜包裹：用爆石灰膏30%（按生石灰的质量比计算）、红黏土30%、草木灰将近40%、硫黄0.5%、三氯均三嗪0.1%、多菌灵0.1%制成细粉，调制成浆状而成。将上述方式得到的浆状药剂置于容器中，把选好的种芋置于容器中，使种芋浸没在包衣剂中，1～5min后取出，一定要阴干或晒干使包衣层牢固地附着在种芋表面，既能有效*虫灭菌，又能部分改善魔芋生长的土壤环境。
但要注意的是，仅靠药膜包衣对已有的隐藏伤口中的病菌、种芋携带的病菌不能*灭。需要把伤口组织切除，然后晒干、熏蒸、再晒干并进行包衣，这样就能把种芋携带的微生物绝大部分去除，可确保出苗整齐、成苗率高。假如魔芋萌芽较长后就不适宜再过多操作，易造成种芋断芽和外损，播种后土壤中的致病菌从创口侵入从而导致病害加重；另外，在操作过程中，要轻拿轻放，以免擦伤表皮，给土壤中病菌侵入创造条件
