首先就是获取水稻不孕的植株，它的存在是一种基因突变，也就是意味着千万株水稻中可能只有一株。而即使找到了一株雄性不育水稻，还需要对水稻上的花进行考察，必须要保证所有的花都是败育的，这也就是指水稻的不育系。
找到一株水稻不孕的植株已是十分困难，更不要说保证所有的花都是败育了。找到一株完美的雄性不育水稻后，我们还要为他寻找到优秀的雌粉，也就是常说的父本。不同的父本杂交的效果不同，水稻的产量也不同 ，最后被挑选中的父本就是恢复雄性不育育性的恢复系。
选好了恢复系还有一个更大的问题，作为粮食作物，水稻并不是只种一季。也就意味着，我们需要培育另一批水稻给雄性不育系水稻授粉，收获的杂种必须是雄性败育的。简而言之 ，就是要保持雄性不育系的不育特点。这批水稻我们就将它称为保持系，该步骤需要保证下一代雄性不育的程度非常高，所以也是水稻三系步骤中最难的一环。
以上水稻育种的历程就是我们常说的“三系法”水稻杂交技术，说完这些理论，我国培养杂交水稻的历程又是怎样的呢？上面我们谈到19世纪20年代，美国水稻学家发现水稻雄性不育现象。1963年，美国的一位科学家首次在印度尼西亚实现了水稻杂交，此次杂交后的成果非常显著，水稻产量在十年内翻了一番。
虽然前人经过不断努力，但是却并没有真正实现水稻的产业化发展，这项关键的一环是由我国科学家接力发展的。1966年 一篇《水稻的雄性不育》登上了《科学通报》，这篇文章正是袁老撰写。在发表后，引起了国家科委的广泛重视。1967年 ，袁老和他的两个助理尹华奇、李必湖，3人组成了“水稻雄性不育科研小组” ，正式开启了我国杂交水稻的研究历程。
1970年，李必湖在海南农场的水沟里发现了一株雄性不育的野生水稻。李必湖立即将他的这一发现转告给远在北京查阅资料的袁老，得知这一消息后的袁老 日夜兼程，立即赶回海南。回到试验田的他，仔细的检查了这株野生水稻，发现这株野水稻除了雄花没有生育能力外，其他的一切功能都是正常的。对于这株野水稻只是在雄性生育方面是失败的，所以袁老也给它起了一个亲切的名字“野败” 。“野败”可以说是如今绝大部分水稻“三系法”杂交水稻不育系的祖宗。
1970年冬天 ，按设想，他们将“野败”带回湖南，然而在湖南遇到了江西农业局的颜农安向他们学习杂交水稻技术，于是 颜龙安他们将“野败”带回了江西。“野败”在江西按时抽穗 ，颜龙安将“野败”的雄性不育性状成功传递给了“二九矮1号” 。
第二年，袁老惊喜的发现 ，“野败”竟然将雄性不育的特点保持了下去 。1972年，团队种植了几万株水稻，这些水稻全部都是雄性不育株。于是，袁老也通过同样的办法，在1973年的秋天 ，成功培育出了“二九南1号”不育系和同型保持系。
