简而言之，当雨季到来时，河流将大量的粪便冲入下游，粪便被分解时消耗大量的氧气，这就导致下游河段严重缺氧，大量的鱼类因此窒息而亡。
随着河流旱雨季的不断交替，马拉河下游的鱼类就会出现周期性死亡。只有当河流的流动趋向稳定时，马拉河流域的生态环境才会趋于稳定。
为了调查清楚鱼群的死亡真相，从2011年开始，生态学家阿曼达·苏巴鲁斯基夫妇，针对马拉河鱼群死亡事件，开展了长达数年的野外调查和水质检测。
通过对河马粪便中营养成分的分析，他们最终确定河马粪便是导致马拉河季节性鱼群死亡的罪魁祸首。据统计，马拉河中有41%的罗非鱼因为河马粪便污染而缺氧中死亡。
然而，河马粪便对马拉河鱼类的危害远不止于此。河马粪便中的大量营养物质，还会导致藻类过度增长。
当这些藻类死亡和分解时，同样会大量消耗水中的溶解氧，继续加重河流的缺氧状态。某些藻类在死亡分解的过程中，还会释放出有毒的物质，直接毒死鱼类。
