果糖在肝脏中的代谢不受磷酸果糖激酶等限速酶的作用，肝脏中内源性磷酸和ATP迅速被消耗AMP脱氨基酶的活性增加，促使AMP降解产生大量的核苷酸，累积大量的尿酸同时，果糖也可以间接促进甘氨酸转化生成尿酸，不断累积的尿酸则会增加心血管疾病的发病风险。尿酸也会通过抑制内皮细胞一氧化氮合成酶的活性，使血管中一氧化氮的含量减少而引起血管内皮功能损伤。
研究发现，长期摄入大量果糖后，可以刺激胰岛β细胞分泌胰岛素和增强葡萄糖刺激胰岛素分泌的作用。机体摄入果糖后，肝脏不断沉积脂肪，从而引起炎症和氧化应激反应，造成胰岛素受体和胰岛素信号传导途径中信号分子的表达受到抑制，导致机体胰岛素敏感性下降，增加2型糖尿病的发病风险。
因此，果糖与2型糖尿病之问的关系应引起重视，蜂蜜等富含果糖的保健食品在糖尿病患者中的食用应引起警惕。
如今，越来越多的大众开始食用并关注果糖，作为天然糖家族中的新品类，果糖为大众的饮食提供了一个新选择。但是果糖属于高热量物质，其代谢方式与葡萄糖不相同，而且最重要的是果糖影响嘌呤代谢，升高血尿酸，成为诱发痛风的重要因素之一。
在短时间内摄入大量的果糖，会产生大量的尿酸，会使血清尿酸水平升高，导致痛风急性发作。在高血压、代谢综合征和其他慢性病中，果糖可能是引起高尿酸血症的一个原因。减少摄入果糖后，血尿酸水平明显下降，提示果糖与高尿酸血症之间存在着因果关系。所以果糖并不是人们所想象的“健康糖”。
