朱标去西安考察了一番，发现西安有一个很大的劣势，即距离江南财赋重地太远。当时我国经济重心已从黄河流域南移至长江流域，西安周边无法满足国都庞大人口所需要的钱粮。从江南运钱粮到关中，路途遥远且成本巨大。朱标向朱元璋汇报了考察情况，让朱元璋也有点犹豫了。皇太子朱标突然去世，白发人送黑发人，对朱元璋打击很大，无心再考虑迁都的事了。
在朱元璋去世后，藩王的势力越来越大，对朝廷统治造成威胁，建文帝朱允炆决定通过削藩来加强统治，结果激化了皇族内部矛盾。驻守北平的燕王朱棣以清君侧为名起兵，史称“靖难之役”。朱棣一路南下，势如破竹，于1402年推翻建文帝，登基为帝，为明成祖。
朱棣登基后，就考虑迁都，北平是他最佳的选择。一方面，北平是朱棣的大本营，另一方面北平（今北京）位于太行山脉和燕山山脉交界处，地理位置优越，且近海、近河，有京杭大运河和海运均可运送江南钱粮至京师，显然比西安要更具优势。最终，明朝还是迁都北平，而西安则失去了汉唐之后再次为都的机会。
