在我国，有机食品和AA级绿色食品的认证实行检查员制度，在认证方法上是以实地检查认证为主，检测认证为辅，有机食品的认证重点是农事操作的真实记录和生产资料购买及应用记录等。A级绿色食品和无公害食品的认证是以检查认证和检测认证并重的原则，同时强调从土地到餐桌的全程控制，在环境技术条件的评价方法上，采用了调查评价与检测认证相结合的方式。
（2）无公害食品是国家农业行政主管部门，针对当前农产品污染和食品质量安全问题在2001年提出的新概念，是指产地环境、生产过程、最终产品质量符合无公害农产品的标准，并使用无公害农产品标志的农产品。无公害食品是把有毒有害物质控制在一定的范围内，主要强调安全性，是最基本的市场准入标准，是以大众化消费为主，而绿色食品、有机食品除强调安全周期外，还强调优质，有着特定的消费群体。
级别不同
有机食品无级别之分，有机食品在生产过程中不允许使用任何人工合成的化学物质，而且需要3年的过渡期，过渡期生产的产品为“转换期”产品。
绿色食品分A级和AA级两个等级。A级绿色食品产地环境质量要求评价项目的综合污染指数不超过1，在生产加工过程中，允许限量、限品种、限时间地使用安全的人工合成农药、兽药、鱼药、肥料、饲料及食品添加剂。AA级绿色食品产地环境质量要求评价项目的单项污染指数不得超过1，生产过程中不得使用任何人工合成的化学物质，且产品需要3年的过渡期，安全级别类似于有机食品。
无公害食品不分级，在生产过程中允许使用限品种、限数量、限时间的安全的人工合成化学物质。
