洪泽湖的水生植物以湖西分布较多，芦苇比较集中分布在淮河入湖尾闾的沙滩上，总面积约有6万余亩。所产芦苇除直接外运作建筑材料和造纸工业的重要原料外，还利用芦苇加工成芦席外运。
此外，湖区还产芡实和莲子，年收购莲子约8万斤。1953年三河闸建成前后，洪泽湖大型水生植物的分布有较天的变化。以前大部分湖面大型水生植物茂密，莲藕、芡实丰盛，有“鸡头（芡实）、菱角半年粮”之说，可见其产量之多。
三河闸建成后，湖泊水位显著提高，不少洲滩被水所淹，大大地缩小了它们的分布面积。目前除湖西尚较茂盛外，大部分湖面已成为开敞的水面了。
兴建水利设施，使洪泽湖的水产资源受到了影响，但是水利方面的效益是巨大的。现在的问题是如何采取适当的补救措施，恢复和增殖水产资源，以达到综合利用湖泊的目的。
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