苍耳雄性的头状花序球形，直径4-6毫米，有或无花序梗，总苞片长圆状披针形，长1-1.5毫米，被短柔毛，花托柱状，托片倒披针形，长约2毫米，顶端尖，有微毛，有多数的雄花，花冠钟形，管部上端有5宽裂片；花药长圆状线形；雌性的头状花序椭圆形，外层总苞片小，披针形，长约3毫米，被短柔毛，内层总苞片结合成囊状，宽卵形或椭圆形，绿色，淡黄绿色或有时带红褐色。
苍耳在瘦果成熟时变坚硬，连同喙部长12-15毫米，宽4-7毫米，外面有疏生的具钩状的刺，刺极细而直，基部微增粗或几不增粗，长1-1.5毫米，基部被柔毛，常有腺点，或全部无毛；喙坚硬，锥形，上端略呈镰刀状，长2.5毫米，常不等长，少有结合而成1个喙。瘦果2，倒卵形。
苍耳的种子要求不大，只需将种子清洗，然后进行风干即可播种。如果需要贮藏一段时间，可将种子放入湿沙中进行贮藏，不过由此种子的发芽率会逐渐下降。贮藏时间不宜过长，不仅不利于发芽，出苗也会不整齐。苍耳一般在每年中秋节前后进行播种育苗，播种前做好育苗床，挖好育苗沟。然后将种子放入育苗沟中，施足基肥，覆好地膜，等到出苗率达到80%左右时将其揭开。出苗后15天左右及时追肥浇水，做好田间管理，当幼苗长至65厘米左右时即可移栽定植。
