苍耳种子出苗后不仅要根据幼苗生长情况移栽，还要观察天气，通常最佳移栽时间在早春。在移栽前要浇足水，挖出幼苗后将残根剪短，带土移栽，移栽不宜过深，移栽后将土壤踩实然后浇足定根水。控制好定植密度，挖好定植穴，因为苍耳是雌雄异株，有价值的部位为果实，因此要保证有足够数量的授粉树与结果数。防止授粉不均，影响结果率，导致产量下降。
苍耳移栽后做好肥水管理，根据土壤的含水量及时浇水，但是水分不宜过多，因为苍耳根部较浅，容易产生涝害。肥料可使用农家肥，记住要充分腐熟，否则会烧坏根部，营养吸收运输受阻，影响生长。并且要及时中耕除草，防止土壤板结，杂草横生，对苍耳的生长造成威胁。
