5.浮游动物
浮游动物的捕食是影响藻类群落结构的重要因子，它能够通过控制藻类的生物量，从而影响水体的初级生产量。不同种类的浮游动物喜食藻类的种类大小不同，例如研究发现哲水蚤的食物主要来源是鱼腥藻，这就造成了浮游动物和藻类群落结构之间的相互影响。
(哲水蚤)
水体中藻类生物量的不同会使浮游动物的群落组成有所差异：例如有研究表明在藻类生物量较高的水体中，尤其是小型单细胞藻类丰富的水体，枝角类由于喜食单细胞藻类而易形成优势种；在藻类贫瘠的水体中，哲水蚤由于能更有效地摄食藻类而占优势。另一方面，藻类对浮游动物的摄食也会产生相应的抵御机制，例如蓝藻、绿藻通过增大自身的体积、数量，紧密的连在一起，使其难以被浮游动物滤食;一些种类的藻类甚至在长期进化中形成了分泌有毒物质的机制来抵御被摄食。
6.养殖模式
我国大宗淡水养殖鱼类主要包括青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、鲫等。其中，鲢和鳙是滤食性鱼类，分布于水体的中上层，鲢主要以浮游植物为食，鳙则主要摄食浮游动物。此外，鲢鱼也能滤食部分浮游动物，研究发现，鲢鱼能够滤食原生动物、轮虫和逃逸能力较弱的枝角类，对逃逸能力较强的桡足类，主要靠滤食其无节幼体来抑制桡足类的生长。因此，放养鱼类苗种的不同也导致了水体浮游生物不同的种群结构。
鲢鱼的滤食作用能够加快养殖水体的物质循环速率和养分的周转率，从而使藻类的生长增加。在实际生产中，一般将草鱼和鲢、鳙进行混养，一方面可以充分利用养殖水体的空间资源和食物，另一方面，三者间的协同作用，可以改善养殖环境并增加鱼类产量。鲤、鲫食谱广而杂，属于底层杂食性鱼类，既吃动物性食物，又吃植物性食物，动物性饵料以轮虫、摇蚊幼虫以及甲壳动物(枝角类和桡足类)等为主，植物性食物则以浮游植物硅藻类、丝状藻类等及其碎屑为最主，对水质有一定的净化作用，能使底栖无脊椎动物的丰度大幅度降低，藻类生物量和水体初级生产力增加。
