另一方面，长时间的浸泡也会造成蔬菜中的许多水溶性营养素如维生素C、维生素B以及钙、镁、铁、锌等溶于水中，从而导致营养成分损失。
因此，用清水长时间浸泡果蔬的这一方法并不科学，不仅不能提高农残的去除率，甚至可能会造成果蔬重新吸附农残及营养成分流失。
如何正确地去除农残？
热水焯：
将蔬菜洗干净后焯水1-1.5分钟可以去除其大部分的农药残留，而且不会对蔬菜的营养成分造成过多损失。以菜心为例，清水漂洗只能去除其残留的甲胺磷含量的30%，而焯水1分钟则可以去90%以上。
去皮：
对于一些不能焯水的水果以及表皮较厚的蔬菜（如黄瓜、萝卜等）而言，可以通过去皮的方式来去除农残。一般的农药仅残留在水果表面，去皮方式的农药去除率可以达到90%以上。
弱碱性水漂洗：
厨房中常见的弱碱性水主要有淘米水、面粉水以及小苏打水。绝大多数的农药在碱性条件下都容易分解，因此使用这类弱碱性水漂洗果蔬，其农残清除率要比普通的清水稍高一些。这用于清洗葡萄、杨梅等效果很好。
