亚麻籽油常见的加工工艺通常有压榨和浸出两种工艺，工业用油一般采用浸出工艺，食用亚麻籽油采用物理压榨工艺；
浸出法工艺是通过化学溶剂把油从油料中分离出来，属于化学方法，但浸出法出油率高、成本低，经济效益较高；压榨工艺是通过物理压力直接把油从油料中分离出来，属于物理方法，但压榨法出油率低，成本高，经济效益较高。
压榨工艺又分为热榨和冷榨两种
热榨亚麻籽油是把清理后的原料烘炒再压榨而得，含有浓郁的亚麻籽香味而微苦，呈褐红色，冷榨亚麻籽油是把清理后的原料直接压榨而得，闻起来有淡淡的亚麻籽香味，品尝微苦，加热后有浓郁的鱼香味，色泽金黄。它们的区别在于过程中是否使用高温，热榨使用高温，可以进一步提高油率；冷榨不使用高温，出油率低。
冷榨亚麻籽油能最大限度地保留亚麻籽油中的营养成分——α-亚麻酸，含量高达55%以上。因此被称为高原上的“深海鱼油”！
