它们的区别主要是看它的花，萱草的花有单层的也有多层的，而黄花菜是单层的，萱草花的颜色是橘黄、橘红色，而黄花菜的花的颜色是黄色的，这是他们最大的区别。
它们的价值也不一样，萱草花色鲜艳，栽培容易，且春季萌发早，绿叶成丛极为美观，所以在很多的公园都能见到它的身影。
萱草花有预防肝炎，改善肝功能，抗忧郁，抗结核，抗菌，抗肿瘤，镇静，催眠等作用。对于肝胆火旺，目赤咽肿者，有辅助治疗作用。
萱草在现代化学染料出现之前，还是一种常用的染料。另外，萱草对氟十分敏感，当空气受到氟污染时，萱草叶子的尖端就变成红褐色，所以常被用来监测环境是否受到氟污染的指针植物。
