技术上遇到的难题，对于中国人来说只需要耗费一些时间即可。但是建造过程所面临的项目冲突，却是虎门大桥建设过程中最为难解决的问题。在92年10月，期待已久的虎门大桥正式开始建设，但是彼时的虎门政府却深陷一处困境之内。
91年5月，虎门的汽车渡口正式建立。渡口的成功运营其目的就是为了畅通两岸交通，提高出行效率。然而，计划远远抵不过现实的需求。渡口设计之初，预计每日可以搭载3000多次的车辆渡江，这样的体量对于当时的运营部门来说，是足以应对的。
但是，正式开放之后，有关部门统计，每天从虎门渡口出发的车辆高达7000多辆，是原来计划的2倍有余，远远超过设计预期。可以想象，每日渡口挤满了要渡江的人，环境质量变差了不说，也严重影响了当地交通。
但是渡口的运营确确实实是为了两岸交通所需，因此尽管当地对此怨声载道，政府也正硬着头皮强行上。
一年之后，随着交通往来需求增加，意识到问题的虎门政府决定采用以桥代渡的方式，解决两岸通行问题。
最初的设想，期待有一座可以完美的解决港澳珠深四地通行的桥梁，减轻渡口的压力，降低运营成本，从根本上解决广东珠江入海口多地的通行问题，支持珠三角经济的发展。
但是，现实的难题摆在面前，让政府不得不妥协。此前，虎门大桥背后还捆绑着一条广深珠高速公路建设项目，但是为了尽快开工，虎门大桥单独设项，即刻开工建设。但是建设预估是从广州南山出发到东莞虎门，但是计划后面由于技术难题等多方面因素，最终改为从广州南沙到东莞虎门。而后兜兜转转，5年之后大桥顺利建设完成。，并投入使用。
