这次刺*事件也导致了周作人最后的投降，1939年他接到了汪伪政府的聘请，让他担任北大图书馆馆长。
他觉得自己是搞文化的，担任图书馆馆长可以更好的保护图书馆的书籍，于是才接受了，也在此之后他开始与日本人合作。
1940年11月，汪伟政府的教育总署督办因肺癌病逝，12月周作人就被任命为华北政务委员会委员，就这样，他成为了汪伟政权的教育大员。1941年之后，又兼任了东亚文化协议会会长、中日文化协会理事。
1945年年底，他以汉奸罪被国民政府逮捕，被关押在南京老虎桥监狱，当时有很多学生为他求情，胡适也写信为他解释。1947年，他被判处10年有期徒刑。
两年后政府赦免政治犯，他也被释放，后来来到上海的一位学生家中暂住。
新中国成立之后，他回到北平定居，据说在当时还给周总理写了长信做了检讨，*批示：文化汉奸嘛，又没有*人放火，现在懂希腊文的人不多了，养起来做翻译工作。
此时周作人已经六十五岁了，他的生活过得也很不错，收入也很高。
他的收入主要有三部分，一部分是人民文学出版社特约翻译的报酬，每个月可以领到200元的稿费，后来还提升到了400元，直到1964年才又降至200元。
他还会给各大报刊杂志写稿，据统计，他曾发表过900多篇文章，刊登这些文章的报刊杂志也会给他支付稿费。
还有一笔收入就是他的翻译了，从1950年开始，他翻译了多部国外经典，包括《伊索寓言》等，稿费也十分丰厚。
除了这些货币收入之外，物质方面，很多的朋友学生每月还会给他寄来各种各样的营养品，包括奶粉，食物，药品等。
到了1965年，情况急转直下，周作人收入水平有所下降，朋友对他的接济也逐渐减少。
先是稿费多次降低，后来更是被彻底取消，翻译和写作工作也受到制约，儿子也被波及，遭到针对。
一家人只能靠着儿媳的70元收入，勉强维生，当时因为身份特殊，他还遭到了很多的针对，即使拿着钱也买不到有营养的大米白面，买到的都是一些粗粮，家中的物资也被搜刮干净。
后来只能买到一些玉米面，每天就着臭豆腐吃一些玉米糊糊。
