科幻片的中心主题是围绕着技术的“异化”而展开的，同时也是对未来社会结构的一种“反乌托邦”的建构，表达了原生主义和自由主义的意识形态。
科幻电影经常告诉观众，尽管科技促进了经济和社会的发展，也在持续地改变着人们的生活和他们所处的世界，但是，人们却往往忽视了科技所带来的消极影响，科技的异化给人性、自然环境、道德体系等带来的消极性影响，从根本上说，它正在慢慢地将人类的世界分解，科幻电影就像是一部影像预言作品，它向我们展示着未来的人类社会，无论是好的还是坏的。
例如，《饥饿游戏》里充满了血腥味的年轻人，《暮光之城》里充满了爱情和自暴自弃的年轻人，《分歧者》里充满了在新的世界规则下，充满了不安的年轻人，等等。
在那些反乌托邦的电影中，年轻人的生活是灰色的，他们的生活是消极的，而年轻人，则是改变现实的关键，他们的爱情，也是被现实所束缚的，所以他们的生活，也是反乌托邦电影中，唯一的乐趣，也是最大的乐趣。
所以，《穿越时空的少女》的剧情太过简单，太过唯美，“时空穿梭”这种无法用现代科技来解释的东西，更多的是一种年轻人的梦想，给人一种虚幻而又现实的感觉。
本片所描述的未来世界并非绝对的“乌托邦”，其叙述空间则是以当下人所处的真实社会为基础的。影片中所描述的科幻元素并没有影响到影片的主题表达，相反，它突出了影片的青春主题，特别是将爱情与友谊所带来的内心深处的青春伤痕展露了出来。
《穿越时空的少女》这部电影，除去超自然力量的因素，从外在的叙述空间、角色和叙述内容上，是一部彻头彻尾的写实作品，也是对我们目前所处的世界的一种真实写照。
电影里的绀野真琴是一个十七岁的纯真女孩，她天生开朗，过着无忧无虑的生活，在学校里，绀野真琴和津田功介、间宫千昭三人形成了一个“铁三角”，她的男孩子性格，让她可以和其他两个男孩子一起玩棒球。
在影片中，我们看到的是一种和谐、宁静的美丽，没有纷争、没有纷扰，所有的事情都像太阳升起、太阳落下、人的呼吸一样自然、有规律、有秩序。
就是因为科幻的因素，才打破了这一点，绀野真琴在一场交通事故中，偶然得到了穿梭时间和空间的力量，从而开启了一段匪夷所思的旅行，改变了三人的命运。不过，让三人分道扬镳的，却是藤谷果穗向津田功介表白的那句话。
这是三个人第一次认识到，他们之间的关系，不仅仅是单纯的友谊，更是一种含糊不清，含糊不清，含糊不清的感情。藤谷果穗的表白，让三人都有了这样的感觉，作为表白对象的间宫千昭和深野真琴，在感情上发生了一些微妙的变化，千昭也渐渐喜欢上了真琴。
