而多尔衮死了之后，作为一国之君的顺治显然已不能容忍有如此强大的正白旗威胁到自己的统治，于是顺治帝亲政之后就将多尔衮的正白旗直接收入囊中变成自己亲领的旗，自此清朝的皇帝就直领正黄旗、镶黄旗和正白旗三旗，并成为了最强大的旗主。而从顺治帝开始，历代帝王也皆为镶黄旗、正黄旗和正白旗的旗主。当然此时最强大的旗还是正白旗，不过旗主却变成了皇帝。不过到了康熙之后随着八旗士兵开始只知贪图享受而不知习武练兵，所以战斗力越来弱，并最终被绿营兵所替代。再加上后期的皇帝对于八旗旗主多有防范，其权利逐渐都被皇帝所控制，后期八旗虽名为八旗，但却最终只是一只又一只的蛀虫罢了，所以也就没有了什么罪强不强之分。
