南朝建安郡、晋安郡、梁安郡（治南安）
南朝陈光大年间析晋安郡地设南安郡，治今南安县丰州镇。闽南分立。
福建形成了闽北、闽东、闽南三大区域。
陈武帝为了满足陈宝应的愿望，特设“闽州”羁糜之。闽州（丰州）治晋安郡侯官县（今福州）。统领建安、晋安、南安三郡。闽地的行政中心从“建州”来到了“福州”。
陈文帝天嘉三年（562）晋安郡陈宝应拥兵自立，攻建安郡城，建安郡太守萧乾拼死抵抗，不为所制。天嘉八年（567）陈军入闽援建安，剿陈宝应，复建安郡，攻晋安郡，全复闽地。因升建安郡守五兵尚书，迁闽州州治于建安县。
闽州的行政中心从“福州”又来到了“建州”。
隋建安郡（治侯官）
隋军南征攻陈，于建安郡遭到重创，日久城破，屠建安县城。
由于南朝滥置州郡县，隋朝统一之后，“遂罢天下诸郡”。这时，隋文帝下诏废建安郡，废南安郡，并将闽州州治由建安县迁于侯官县，改名泉州（这个泉州不是以后的泉州，泉州和福州的名字历史上经常混淆）。又改泉州为闽州。又废闽州，复建安郡，改侯官为闽县，建安郡治闽县（今福州），而原建安郡城废为属县。这是一种很特殊的情况---建安郡的郡治不在建安县，却在闽县，可见隋军攻陈时，建安郡城所受的重创之深。
建安虽然靠近中原王朝，能够得到更早更大的开发，在改朝换代时，却也是第一个受到重创的地方。千年之后，历史将再次上演。
这时福建全境只剩下建安一郡，下辖闽、建安、南安、龙溪四县。
唐天宝长乐六郡建安郡、长乐郡
唐初罢郡置州，以州领县。高祖武德四年（621）迁建安郡治回建安县，并改建安郡设建州，下辖建安（今建瓯）、闽县（今福州）、唐兴（今浦城）、建阳、将乐、绥城（今建宁，泰宁）六县。
建州成为唐代在福建设立的第一个州，也是最大的一个州。福州又一次暂时的为建州所辖，建安县为福建北半部中心。
武德六年（623）析建州闽县地复设泉州（即今福州市，泉州福州的名称依然混淆）。
垂拱二年（689），析泉州（今福州）南部分新设漳州。
景云二年（711），改泉州（今福州）为闽州，新设泉州于闽南。此时建州辖建安、唐兴（今浦城）、邵武、沙县、将乐、建阳六县。改泉州都督府为闽州都督府，督闽、泉、建、漳、潮五州。
天宝年间，玄宗将“天下诸州改郡”，仍行郡县二级政区制。置长乐经略使于长乐郡（今福州），兼领长乐郡、建安郡、清源郡、漳浦郡、临汀郡和潮阳郡六郡的边防军事事务。
福建的中心再次由“建州”来到了“福州”，“福州”也在这时，正式奠定了福建“省府”的地位。而“建州”在此后的千年的大部分时间里，都作为福建的第二“省府”。
唐开元福建五州
唐开元十三年（725）改闽州称福州，“福建”的“福”第一次出现在历史上。开元二十一年（733），各取福州、建州首字，设置“福建经略使”，“福建”终于正式出现，此后至今成为闽地的统称。
先后设立福建防御使，福建节度使，福建观察使。由福建观察使分管福、建、泉、漳、汀五州，二十四县。
传统的福建五州—福、建、泉、漳、汀也在此时形成。
唐末五代，天下大乱，王绪等率军入闽，后由王审知后裔建立闽国。都福州。后梁开平三年（909），封王审之为闽主。升福州为长乐府，仍置建州、泉州、漳州和汀州。
在唐宋的历史上，一般来说，都城、陪都所在州才会被升为府。从玄宗之后，凡皇帝驻跸地皆升府。其地位高于州。
福州是福建第一个升府的州。而建州是中原王朝在福建第一个升府的州。
