报警
深圳公安接到了杨云父母的报警电话后十分重视，但当时跨地区办案的能力比较有限，而那个时代的深圳还没有完善监控视频网络。
四川省一位学生失踪，要在深圳当地找寻难度不小，又过了几个月巴中市公安局经济技术开发区公安分局向深圳市公安局发出协查杨云的传真，深圳警方对此也非常重视。
但无论是走访当地的电子厂，还是查询酒店广告和出入境信息，均未找寻到杨云的踪迹。
在这期间杨云父母也没有放弃寻找孩子的下场，他们借钱贷款，多次去往深圳实地走访调查，与多方公安进行联络，但都一无所获。
走访
随着找寻时间的不断增加，就连公安也劝导杨云父母，孩子如此长时间的失踪，极大可能是已经身亡，并且遗体也无法找寻。
杨青森，廖庆华夫妇失魂落魄地回到了老家，再找杨云的这段时间近乎耗费了他们全部的财力和精力。现在孩子没了，夫妇二人便将矛头指向了杨云所在的学校。
2007年杨云父亲杨青森、母亲廖庆华向巴州区法院起诉，要求四川省巴中市巴州区学校寻赔偿损失共30万元。
打官司
虽然当时学校负责人邱文茂和学校负责人杨菊珍向法院解释这十几年来他们也耗费很多精力和财力去寻找杨云，同时因为杨云的失踪导致学生数量减少，也给他们造成了一定的损失。
而且在某种程度上来说，安置学生学习一技之长打工赚钱是主要责任，学校做不到严格管理学生的生活起居，这才让杨云钻了空子。
法庭解释
但显然邱文茂和杨菊珍的解释具有主观性，毕竟杨云当时是一个心智不成熟的未成年人。
2009年底，距离杨云失踪已经过去了整整四年，杨云的父母接受了杨云失踪不见的事实，他们向巴州区法院申报杨云死亡。
巴州区法院因杨云死亡判决邱文茂杨菊珍两人需要为杨云的失踪负全责，两人需要赔偿杨云父母精神损失费等各种费用总共30万元。
因为当时学校法人邱文茂名下没有财产，杨菊珍名下的三套门面房算作夫妻共同财产，所以巴州区法院依法执行了杨菊珍的财产，在2015年对杨菊珍名下的三套门面房进行拍卖。
