巨型阿米巴虫主要生长在海床的沉积物上，可以呈现出完全不同的形态，有的像花朵，有的则像网格。在深海这片寒冷、漆黑、高压、缺氧等为主要特征的特殊环境下，它们和珊瑚一样，也创造出一片独特的栖息地。
深海巨大单细胞生物的“家园”
在太平洋、大西洋等底部存在巨大海沟的广袤海洋中，巨型阿米巴虫在海床上分布应该是十分广泛的，在海底生态系统中也发挥着重要作用。
一方面，巨型阿米巴虫在海床上，依靠着“迎接”上方沉降下来的有机物质和矿物质颗粒，利用比较大的细胞体来包裹住这些物质，从而在黏稠的细胞内部将这些物质分解消化和吸收，之后将无用的物质以及代谢产物排出体外。
另一方面，巨型阿米巴虫也能够根据海床的条件，在沉积物中和沉降物质中寻找适合建造“房屋”的颗粒物质，并且将这些物质“组装”成比较精致的“建筑结构”，在建成的“建筑外壳”内部，巨型阿米巴虫的细胞会像树枝一样在内部进行扩展，延伸到每一个角落，在细胞、“建筑物”和剩余的空间共同作用下，巨型阿米巴虫就像一个微型的世界一样，展现在深海的海床之上。
这个微型的世界，不但对于巨型阿米巴虫具有很好的栖息、捕食和防御功能，对其它一些动物来说，也是一个非常舒适的“避风”港湾。据有关人员检测，在一个普通的阿米巴虫细胞内，差不多有近20种动物群体在里面生活，较大的阿米巴虫里面甚至能找到100个左右的动物群体，比较常见的是一些软体动物、海绵、小型甲壳动物等。一些深海鱼类，比如狮子鱼，有时还会将卵产在巨型阿米巴虫细胞所建造的“房子里”，这种“房子”的结构，可以为胚胎的发育和卵的孵化，提供得天独厚的条件。
人类活动对巨型阿米巴虫的影响
自从巨型阿米巴虫被发现以后，人类对这种巨大单细胞生物的兴趣越来越高，这里面的原因，并非全部来源于科学工作者的科研需求，更大程度上，是很多人瞄准了巨型阿米巴虫周边环境中的“经济价值”。
刚才提到了，巨型阿米巴虫可以利用细胞的生理功能，来吸取上方沉降以及周围环境中的有机物残渣和矿物质颗粒。然而，在巨型阿米巴虫栖息的海床中，也存在着一种天然形成的海底矿藏－金属结核。从外观上看，这些金属结核都有拳头大小，内部包含着化石或者其它成分，表面被一层晶体所覆盖，这些结核的生长速度非常缓慢，每百万年或许只能增厚几毫米，体积较大的结核体，甚至能有几千万年的历史。
