细菌，在人类未诞生，它们已经遍布于地球的各个角落。无论是几千米之下大洋海沟深处还是寒冷的南北两极。
人类出现以后，细菌遍覆盖着人体的内外。它们产生的蛋白质会影响我们的消化、健康，甚至让人类生病。
肠道细菌
据估计，人体内外含有的微生物群的细胞，包括细菌、真菌和其他微生物比人体细胞还多。单单就在人类肠道中就发现了4600多种细菌。
为了了解细菌物种在人类人体生物学中扮演的角色，科学家们通常在实验室中分离并培养它们，然后对它们的DNA进行排序。然而，许多细菌在实验室环境中无法繁殖的条件下繁殖。为了获得这些物种的信息，研究人员采取了另一种方法：他们直接从人类内脏收集单个样本，对整个样本进行DNA排序，然后使用计算方法从单个样本中重建数千个物种的个体基因组。这种被称为宏基因组学的方法，提供了一个强大的替代方法来分离和测序单个物种的DNA。
肠道细菌
最近，一个国际科学家团队将人类肠道微生物中所有已知的细菌基因组整理成一个大型数据库，供以研究人员能够探索细菌基因和蛋白质之间的联系，以及细菌如何对人类健康产生影响。
人类肠道的微生物
人类的肠道是许多种类微生物的家园，这些微生物统称为肠道微生物群。
科学家们现在已经收集了人类肠道中4600多种细菌的20万个基因组和1.7亿个蛋白质序列，并建立数据库，这个新数据库是微生物组研究的里程碑，揭示了我们人类肠道内的巨大多样性，、进一步的微生物研究铺平了道路。
细菌百相
尽管科学家长期致力于这一领域的研究，但肠道菌群中的一些微生物种类、在很长时间内不为人所知，超过70%的被检测到的细菌从未在实验室中培养过——它们在体内的活性仍然未知。例如人体肠道内最大细菌群是Comantemales，这一肠道细菌序列首次在2019年被发现。而且生活在肠道中的不同微生物种类，对人类健康的作用也是不同的，这无疑增加了工作的难度。
科学检测
除此之外，世界各地人群肠道细菌组成也存在差异。研究人员在欧洲和北美人口的数据中发现了许多相同的细菌物种，然而获得的少数南美和非洲数据显示这些细菌物种却并不没有显著的。这表明，如果想真正全面地了解人类肠道的细菌组成情况，从未被充分代表的人群中收集数据是至关重要的。
肠道细菌
人类肠道的细菌公共数据库能够让科学家了解许多生活在人类肠道细菌物种，以及它们如何发展，它们可能在人体中会扮演什么样的角色。
这样的研究正在帮助人类建立一个人体肠道细菌群落图，在未来可以帮助我们更好地了解人类健康和疾病，指导胃肠道疾病的诊断和治疗。随着来自世界各地研究团队的新数据集的出现，这个数据库可能会扩展到包括其他身体部位的微生物群，比如皮肤或口腔内的细菌，为人类服务。
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