从外观差异来看的话，相比来说，小麦粉采用了更加精细的加工方式，因此制成的面粉看上去更加细腻、洁白，且面粉颗粒比较均匀，而全麦粉的加工程度较低，且采用整粒小麦加工，因此制成的面粉中常带有麸皮之类的物质，整体看上去颜色较暗淡，呈浅褐色，且粉末颗粒大小不均匀，摸起来较粗糙。
从松软细腻VS麦香味的方面来比较的话，由于加工过程和所含成分的不同，因此，用小麦粉做出的食物往往结构较蓬松，食用时能很容易嚼碎且表现出细腻的口感。
而用全麦粉做出的食物，则表现为结构紧实，食用时会感觉不易嚼碎，尤其是冷却后的全麦粉食物，不仅嚼起来硬梆梆的，甚至有时还有有几分喇嗓子，尽管如此，食用全麦食物时，充斥唇间的浓郁麦香实在让人难以割舍。
在营养成分方面，小麦粉是只保留了部分胚乳，所以面粉中的营养成分，跟多是淀粉和少量蛋白质，而全麦粉则是使用完整的麦粒进行加工，成粉出胚乳的营养成分外，还保留了小麦麸皮和胚中的营养成分，因此行业内普遍认为全麦粉的营养价值高于小麦粉。
