分布在广东福建两地的海防卫所与水寨
明朝官方对此也是心知肚明，因而在漫长的海岸各头设有众多卫所水寨。甚至不惜以放弃地盘收益为代价，强制将许多小岛的居民搬迁到内陆生活。走马上任的父母官也懒得区分涉事对象，经常将自己的问题过失都甩锅为倭寇作乱。但却从未有能力从根本上解除矛盾，只得以时而激进、时而放任的手法予以灵活调剂。因而早在倭寇问题大规模爆发之前，类似现象就已在浙江舟山、福建漳州或广东的海南不断上演。
当然，明朝的高压维持政策，势必给地区内的经济造成严重打击。大量官员和驻军的日常花销，又足以让本不富裕的国库迅速见底。这就给各倭寇集团的勉强生存创造了空间，让他们能通过黑市进行大量物品交换。特别是在15-16世纪之交，又成功搭上西方大航海时代的春风，开始获得远超过去的白银等贵金属货币。加之许多地方士绅参与进来分一杯羹，便将行贿网络发展至府衙与军营当中。一些早已被废弃的荒岛、峡湾，也是在他们的共同努力下恢复生机。
突袭舟山双屿港的明朝官军
不过，倭寇的黄金时代很快就因嘉靖皇帝登基而被强行打断。为了牢固中央宫廷对基层税源控制，他经常亲自出手干预地方上的涉外事物，用最粗暴的手段强化封禁祖制。一批取向保守的儒教文官借机获得提拔，并故意在此类问题上表现出乎寻常的激进亢奋。于是，尚不熟悉天朝传统的葡萄牙大使被勒令斩*，大闹宁波的日本朝贡商团也被永久挡在浙东市场之外。最后，又把严打目标锁定在本土倭寇身上，将对方苦心经营多年的双屿港摧毁。
讽刺的是，这次剿倭行动的主要执行者都落得兔死狗哼下场。嘉奖皇帝为安抚广大地方官僚士绅集团，接受了由他们秉承自己的繁多举报。最后逼的钦差朱纨直接自*，大将卢镗也因受牵连被革职关押。
经常造访闽浙沿海的倭寇船只
一切向前看的假象
