近年来，我国畜禽养殖业发展迅速，导致畜禽养殖业布局不合理、种养脱节，部分地区养殖总量超过环境容量，加之畜禽养殖污染防治设施普遍配套不到位，大量畜禽粪便、污水等废弃物得不到有效处理而未进入循环利用环节，导致环境污染，且未得到资源化利用，直接妨碍了产业综合效益提高。因此，畜禽养殖业要实现可持续发展就必须搞好养殖业废弃物的综合利用，走种养结合、种养平衡的生态化、循环化路子。
一、有机肥生产
1.1、堆肥发酵
将畜禽粪水固液分离，将固体粪便堆肥发酵，在堆沤过程中，有机物分解，由不稳定状态转化为稳定的腐殖质物质。堆肥时间随碳氮比、湿度、天气条件、堆肥运行管理类型及废物和添加剂的不同而不同。一般堆肥在夏季堆肥时间一般为15-30天，在复杂的容器内发酵堆肥只需7天即可完成。堆肥过程中，温度、湿度是关键，湿度过高过低都不利于堆肥发酵，只有当湿度适中的堆肥有机质分解产生热能促进大量微生物繁殖发酵，当堆肥内温度超过55°C,这样才能既有利于微生物发酵又能*灭病原体。腐烂气味出现时可能意味着堆肥由好氧转为厌氧。另外为加快堆肥发酵过程的时间还可在畜禽粪便中加入生物菌剂(主要由老合菌、乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌、放线菌等多种有益菌种复合而成)，这些菌株利用粪便中的有机物作为营养源，通过大量繁殖完成粪便有机物的降解处理。通过发酵处理后，畜禽粪便腐熟，施在土里就不会引起作物根系烧苗的现象。这种堆肥发酵可用于猪鸡羊牛等畜禽粪便的处理。
堆肥发酵
1.2物理机械烘干
堆肥发酵后，少量的堆肥可直接施在土壤中作为有机肥。对规模较大的畜禽养殖场经过发酵处理后利用物理机械烘干设备对固体粪便进行烘干、装袋，销售给农户作为有机肥料。
二、燃料能源利用
2.1沼气生产
沼气生产时畜禽粪便处理常用的方式特别是养猪场猪粪处理。可用于猪-沼-果（蔬菜）模式。“猪-沼—果（蔬菜）”是以沼气为纽带，联动生猪和果业（蔬菜）等种养、加工业综合发展。用猪粪等畜禽粪便作为原料，在沼气池密闭环境中厌氧发酵，产生甲烷作为燃料，而沼液、沼渣作为有机肥还田种水果或蔬菜等作物。
沼气生产
2.2直接焚烧
畜禽粪便褥草直接焚烧。
直接焚烧
三、开发饲料资源
畜禽粪便特别是鸡粪中含有较多的可利用营养物质。由于鸡的消化道较短，饲料在鸡的消化道停留时间短，对食物的消化吸收能力差，饲料中部分营养物质未被充分消化吸收而排出体外。因此，国外用鸡粪发酵、干燥等综合手段开发出再生饲料。在用于其它畜禽饲料时少量添加，且与其它饲料搭配。如:鲜鸡粪喂猪、喂鱼。
四、其他利用模式
4.1稻鸭共育
稻田养鸭，利用鸭旺盛的杂食性，鸭吃掉稻田内的杂草和害虫;反复践踏破坏杂草根系，利用鸭不间断的活动刺激水稻生长，产生中耕浑水抑制杂草生长的效果;同时对水稻害虫均可有效控制。鸭的粪便还可以作为有机肥料，稻鸭共作时期内，一.只鸭排泄在稻田里的粪便约10公斤，相当于:氮47克，磷70克，钾31克，稻鸭共作的最佳密度是每亩20-30只为适当，既解决了养鸭的污染问题，又解决了水稻的肥效、除草除虫中耕等问题，是发展有机农业的一个很好模式，所排泄的粪便足够稻田的追肥了。在稻田有限的空间里生产无公害、安全的大米和鸭肉，所以稻鸭共作技术是一种种养复合、生态型的综合农业技术。
稻鸭共育
4.2林下养鸡
利用果园、林地、荒山荒坡、草场等自然条件放牧养鸡，鸡只觅食虫、嫩草、刨树籽草籽，每天只需要补充少量的五谷杂粮、糠麸饲料，鸡粪肥园肥林。林下养鸡的关键是掌握放养的适当密度，密度高了，超过了土壤吸收肥力的标准，反而产生不良后果，导致有机物的富集，不利于树木的正常生长。通过某地区的林下养殖试验，最好控制在每亩10-30只，并在树之间种植牧草，采取轮牧的方式，提高土壤对鸡粪的利用率。这样林下养殖，既改善了果子的口感又增加了养鸡的收益,通过鸡粪增加土壤肥力,促进土壤疏松，拓展了有机肥的供给渠道，节约了成本。
林下养鸡
4.3食用菌栽培
畜禽粪便与适度的草料及其他相应的辅料混合通过一定时间的建堆发酵，可用于种植平菇、蘑菇等食用菌。生完食用菌后可以将菌糠还田作为有机肥料。
食用菌栽培
,
