从构建的进化树可以看出，Psy2在植物与原核生物中的进化距离较远，被聚类到具有最大差异的两个独立分支上。
在真核生物分支中禾本科植物玉米、高粱、二穗短柄草、大麦和水稻被聚类为一类，其中，玉米、高粱和二穗短柄草被聚类为独立分支，大麦和水稻被聚类为另一分支。
真核生物的另一大分支中，黄瓜和毛果杨被聚为独立小分支，他们与大豆、葡萄、拟南芥的进化关系依次由近及远。
由此也看出，不同物种中该基因的进化关系与物种进化关系一致。
根据Psy2基因转录本信息，设计分别带有5`端BamHⅠ和3'端SpeⅠ酶切位点的基因特异性引物，PCR扩增得到长度为386bp的psy2a-RNAi干扰片段。
中间载体P1022的内含子大小约为120bp，Psy2基因的Psy2a-RNAi干扰片段大小为386bp，利用两次双酶切装配正、反义片段，得到RNAi表达盒的大小约为892bp。
表达载体P3301的空载体的BamHⅠ和SacⅠ两酶切位点序列较为靠近，因此，双酶切后只能看到一条表达载体线性条带。
