我们通过对人 CFTR蛋白氨基酸对进行数学安排，来判断能否根据其在蛋白质上出现的频率来判断一个氨基酸对的可预测性。人的 CFTR是一种含有1480个氨基酸的蛋白质。第1、2位的氨基酸确定为一对，2、3位的氨基酸确定为一对，3、4位的氨基酸确定为一对，直至1479、1480，共计1479对。例如，人类 CFTR的丝氨酸“S”数为123，而亮氨酸“L”数为183，则 LS的氨基酸预报概率为15 (123/1480×183/1479×1479=15.209)。
但实际上， CFTR蛋白中恰好存在15种 LS型氨基酸，因此通过对其进行数理排序，可以对其进行预测。而人类 CFTR蛋白中的 Glu “E”为93, Glu “G”为84，其氨基酸对 EG的预报概率为5 (93/1480×84/1479×1479=5)，即 CFTR蛋白中应有5种 EG氨基酸对。然而，在 EG中，氨基酸与 EG共发生12次，所以，采用数理排序法， EG中的氨基酸与 EG并不能被预期。
3.可预测和不可预测氨基酸对的变异情况
一种基因的点突变可以取代两种氨基酸对。举例来说，在336位点的变异中，异亮氨酸“I”变为“K”赖氨酸，由于赖氨酸的“K”定位在335位，而苯丙氨酸的“F”定位在337位，因此，两种氨基酸对的 KI、 IF分别变为 KK、 KF。表1给出了各氨基酸对的真实发生频数及预计发生频数，从而判断各取代的氨基酸对（KI、 IF）及新取代的氨基酸对（KK、 KF）是否可以预见或无法预见，并利用网络软件计算各 CFTR蛋白质的氨基酸对发生变异的可能性。
4.预测频率和实际频率的差值
在此基础上，计算其与真实发生频率（PF-AF）之间的差异。从表1可以看出，在突变之前，被替代掉的氨基酸对的预测与实际频率之差为（7-9) (7-13)=-8，而被替代出的氨基酸对为（6-5) (5-4)=2。经基因敲除后，(7-8) (7-12)=-6,(6-6) (5-5)=0.根据上述的结果，我们可以对比出变异对不同的氨基酸在频谱上的差异。
5.统计分析
通过对已知的可预测性与非可预测性的氨基酸，对物种/氨基酸对的基因变异率进行卡方检验，通过Kruskal-Wallis的单因子方差分析=对已知基因变异进行比较，通过邓恩试验对已知基因变异的基因变异进行配对与多重对比。P<0.05为统计学意义上的差异。
1.人类CFTR蛋白中的氨基酸对
20个天然氨基酸（202）是由20个天然氨基酸构成的400个氨基酸对。从以上的数据可以看出，人类 CFTR蛋白质共有1479对氨基酸，比400要高得多，表明有些氨基酸对是不止一对。
另外，人类 CFTR蛋白中并非全部含有这400个理论氨基酸对。由于人类 CFTR蛋白含有1479个氨基酸对，所以人类 CFTR蛋白仅含有343个氨基酸对（400-57=343)，有些氨基酸对还不止一次地出现（图2）。
