4.变异导致的氨基酸对的频率差异
图1所示为178种变异对于氨基酸对所预言的频率相对于真实的频率的作用，而图2所示为其统计对比的结果。在突变之前，已被取代的氨基酸对的真实频数和真实频数的平均值为-3，说明真实频数比真实频数高。而被取代的氨基酸对的对应数值为0.5，说明该基因的变异使氨基酸对的组合更加具有随机性。经突变后，取代的氨基酸对的真实发生频次与预期频次之差均为-1。
近年来， CFTR的研究已经发现了1500多种遗传突变，并根据其在疾病中的作用将其划分为6种类型。研究表明， CFTR基因存在基因变异，但目前仅报道了178种蛋白变异。一些氨基酸发生变异的频率高于另一些，这是当前两个理论的结果。
第一类为方向性变异，其所确定的“热点”对内外源变异均有较高的敏感性。第二个理论是“功能选择理论”，它主张通过基因变异来影响一个蛋白的功能。然而，对于一些特定的氨基酸对基因的变异更加易感的原因，上述理论并不能给予完全的解释。
由于自然界的随机性无处不在，使得氨基酸配对具有极大的可能性，并且与天然条件下建立氨基酸配对所需的最低时间、最低能耗相吻合。不可否认，在很多情况下，蛋白的功能性位点更多地是人为演化的产物，其真实发生的概率与预期发生的概率并不一致，这也是为什么我们只能从随机的角度去解析其组成，而无法从随机的角度去理解其作用。
这表明，该基因的错义变异倾向，在某种意义上与其所预言的氨基酸对发生频数相近。正常情况下，真实频谱与预期频谱相差较大的氨基酸对往往会出现偏差，因此必须进行蛋白变异以缩短两者间的距离，但这种变异会导致某些蛋白的某些功能丧失。然而，由变异所形成的一对氨基酸，却有可能造成新的变异，使变异得以延续。
