同时做到各分区间既要联系方便，又要有防疫隔离。
水禽舍的合理排列关系到场区内的小气候、水禽舍的通风和采光、房舍之间的联系、道路和管线的铺设以及土地利用率等。
水禽舍一般采用东西成排或南北呈列的方式排列，即水禽舍应平行整齐排列，不能相交。水禽舍的排列根据场地形状、禽舍长度和数量可设置为单列、双列或多列式。
当水禽舍的排列与地形地势、气候条件、朝向选择等发生矛盾时，可将水禽舍左右错开、上下错开排列，同时注意平行原则，避免各禽舍相互交错。
例如当场地限制水禽舍长轴必须与夏季主风向垂直时，禽舍应左右错开呈“品”字形排列，与主风向形成较小角度时，禽舍左右列应前后错开，利于防疫和通风。
废弃物处区是水禽养殖场污物集中的区域，主要包括兽医室和病死水禽解剖、化验、处理及隔离等房舍，还包括粪便污水贮存和处理等设施，是卫生防疫和环境保护工作的重点区域。
需建在下风向和地势最低处，且与其他功能区保持一定距离，一般在 50米以上，并且最好在四周设置隔离屏障 （绿化隔离带等)，防止疫情传播。
场区内的道路规划与水禽疫病防控息息相关，道路应不透水，路面材料可根据条件选择柏油、混凝土、砖、石或焦渣等，路面断面坡度为1~3°，道路宽度根据用途和车辆宽度决定。
