清康熙末年,长江口北岸开始新的淤积,许多小沙洲逐渐并连形成启海陆地。乾隆三十三年(1768年),划通州19个沙、崇明11个沙和新涨的10个沙,设置海门直隶厅,隶江苏布政使司,现在启东中部地区,当时为海门直隶厅东境。
雍正至光绪初年(1723---1875年),长江口北岸的惠安沙、杨家沙、永丰沙等13个沙洲陆续形成并连成一片,因临近崇明,称崇明外沙(崇明岛为内沙)。光绪二十三年(1897年),崇明县设崇海司巡检署于九龙镇(久隆镇)。崇海界河南为崇明外沙,北属海门。通海界河以南为海门,以北为通州。
1928年,崇明外沙(即现在的启东南部地区)脱离崇明县的管辖,设立启东县。辖友助、和济、强明、进德、昌明、辅安、德风、广益、乐同、连丰等10个乡。县政府设在汇龙镇,全县人口30万。启东市委党史办副主任印雪平告诉记者:真正意义上的启东,直到1949年1月启东、海门全境解放,两县恢复建置,海门的东部地区、南通的吕四地区划归启东,隶属苏北人民行政公署区南通专署,才形成目前的启东区域。