排序后会发现上方有很多橙色的reads,根据上一章的内容,橙色表示成对的另一条reads比对到了6号染色体上,并且这些reads中有很多soft-clipped base,可以证明这里就是SLC34A2上的融合断点。
06
打开融合基因中第二个断点的位置
在橙色reads中任选一条,右键选择"View mate region in split screen",整个窗口会分为左右两个部分,分别展示两个断点的情况。
07
同时打开两个断点的另一种方式
在菜单栏中选择"Region"→"Import Regions",导入断点发生的两个位置,chr4:25,663,827-25,669,426和chr6:117,655,428-117,661,029。