《物种起源》一发表就遭到了许多人的抨击，并引发了好几次大规模的论战。在这几次论战中，也暴露了,进化论的两个缺点：
- 达尔文的进化论只解释了人类是怎么来的，但没有解释为什么我们会和父母长得很像的问题，也就是遗传学问题。
- 达尔文也没有解释清楚变异究竟是咋回事？
几乎和达尔文同一时期的奥地利牧师孟德尔解决了第一个难题，他没日没夜地在种豌豆，并进行大量的统计，这时人们才知道了显性遗传和隐性遗传的机制。
孟德尔还提出了遗传因子的概念，他认为：
这些遗传因子互不融合，互不干扰，独立分离，自由组合，具有颗粒性。
这就是大名鼎鼎的遗传学的分离定律和自由组合定律，孟德尔解决了形状和遗传之间的关系，也就是说，解决了我们会和父母长得很像的问题。而美国科学家摩尔根进一步确认了细胞内的染色体承载着物种的遗传物质，并且奠定了现代遗传学。那第二个问题：变异呢？
DNA双螺旋结构1953年，沃森和克里克发现了DNA分子双螺旋结构，从此破解了生命的奥秘，也了解到基因突变对物种变异和进化的影响。
科学家终于明白：可遗传的变异来源于基因突变、染色体变异。
这些现代生物学和遗传学的结果，都支持了生物具有共同祖先的说法。
从个体到群体但这还没有结束，在自然界没有哪个个体是不会死的，随着个体的死亡，它表现出的形状也会消失。不过，决定性状的基因也会随着生殖而世代延续，并且在群体中扩散开。
所以，研究生物的进化，仅研究个体是不够的，更应该研究的是：一个群体的基因变化。
于是，科学家把生活在一定区域的同种生物的全部个体叫做种群。一个种群中全部个体含有的全部基因叫做种群的的基因库。
