从这个种群的角度来看，
可遗传的变异来源于基因突变、基因*和染色体变异。
在自然选择作用下，种群的基因频率会发生定向改变，使得生物朝着一定的方向不断进化。
隔离与物种的形成如果不同种群之间，基因不能进行自由的交流，我们就把这种现象叫做隔离。而隔离就有可能产生新的物种。
比如：因为地理上的阻碍，导致种群之间无法发生基因交流，就叫做地理隔离。
再比如：不同物种之间一般是不能相互交配的，即使交配成功，后代也不能生育，这就叫做生殖隔离。最典型的就是马和驴之间就有生殖隔离，它们产生的后代骡子就不能再生育。
生殖隔离一旦形成，原来属于同一物种的生物，就成了不同的物种。
但还有个难题没有得到解决。看起来似乎很完美了，但是进化论还是存在很多问题，其实这和物理学发展很像，当我们能解释的东西越多，我们发现我们不能解释的东西就越多。
目前，进化论还面临着一些问题，比如：
1，中性突变问题。
2，生物大爆发问题。
我们先说一下中性突变问题，有科学家认为在分子水平的进化上，达尔文的自然选择不能起到作用。具体来说，他们发现有一些基因突变是自然选择不起作用的，所以这些基因突变就被叫做中性突变。
但这些基因突变经过长时间的积累，也会导致种群之间遗传物质出现较大的差别。于是，日本遗传学家木村资生提出，
决定生物进化方向方向的是中性突变的逐渐积累，而不是自然选择。
但也有学者坚持，
基因突变并不是都是中性的，有些基因突变是反映在个体形状上的，并不能否认自然选择的作用。
除了中性突变理论，还有生物大爆发的问题，科学家发现，距今5.7亿~5亿年的寒武纪发生了一个重大的事件，在不到地球生命史百分之一的一段时期里，突然就演化出了绝大多数的无脊椎动物门类。我们管这个叫“寒武纪大爆发”。
当年达尔文也感到很困惑，因为按照进化论的理论，每一种生物必定是从低级的其他生物逐渐进化而来，但“寒武纪大爆发”的力度远远大于预想的那样。所以，进化论无法解释“寒武纪大爆发”，所以科学家也在思考是不是存在着大突变或者大进化的特殊规律和机制。
关于进化论的争论和挑战还有很多，而这套理论也还在迭代和升级，今天，我们就先讲这么多。
