除了编制以外，战舰部队和游击部队还有许多区别：战舰部队的机体可返回战舰补给，而游击部队则无法返回，但可以根据站位回复。比如两台机体站在一起就会回复一定血量和EN，如果离得很远则可以回复大量EN。
很多战斗中还分为不同的地区，玩家需要合理运用策略，在不同的区域随时切换来掌握战场上的主动权。
（注意左上角）
此外还有“全体移动”的功能，可以方便玩家的操作，只要小队其中一个机体去目标点，其余机体就会自动移动至附近。接近战中并不建议大家使用本功能，“全体移动”只有在赶路时才是最有用的。
（曙光社里满满的量产M1异端）
战斗动画充满美感，也有不足
本作的战斗演出非常精彩，所有比较有名的机体和角色都有专属的战斗动作及语音，“战舰联攻”和“游击联攻”的场景也非常震撼，如同真正的宇宙大战一般。该系列“亲儿子”凤凰高达和旋风高达的战斗画面一如既往地华丽。
