胭脂鱼（摄影：邱宁）
胭脂鱼（Myxocyprinus asiaticus）又名黄排、火烧鳊，是胭脂鱼科在我国唯一的代表种，分布于长江和闽江。目前闽江的胭脂鱼已经很难见到了。胭脂鱼和白鲟相似，也是跨太平洋分布的古老类群。只不过其近亲类群亚口鱼类在北美仍留存有70多个物种，但是在亚洲仅孑遗胭脂鱼一个物种。因此，对于研究欧亚大陆与北美大陆的地质历史和生物交流过程，比较两个大陆的生物类群演化差异也有着重要的研究价值。
胭脂鱼体形侧扁，背鳍起点处隆起，幼鱼体色桃红或墨绿，成鱼通体呈现猩红色纵横，好似涂抹胭脂一般，色彩十分绚丽，被人们荣称为“一帆风顺”，在东南亚享有“亚洲美人鱼”的美称。胭脂鱼在长江上、中、下干支流和湖泊中皆有分布，但产卵场主要在长江上游干流及金沙江、岷江和嘉陵江。成熟亲鱼在繁殖季节（3-5月）上溯洄游，在水流湍急的砾石和乱石滩上产卵，仔鱼和幼鱼随江水漂流到中下游或附属湖泊中生长。葛洲坝修建之后，长江中下游的胭脂鱼群体无法上溯至上游产卵场，但在坝下形成了新的产卵场。
胭脂鱼人工繁殖技术的发展已有较长历史，自1978年四川省万州水产研究所首次获得胭脂鱼池塘人工繁殖成功后，各地水产所每年均开展了大量的胭脂鱼增殖放流活动。根据中科院水生所1996-2018年的野外监测记录，每年都会有一定数量的胭脂鱼幼鱼或成熟亲鱼被误捕（年均14尾），表明胭脂鱼在长江中仍维持有比较稳定的种群规模。
花鳗鲡：我的名字很美，但我不想成为传说。亲爱的人类啊，请把我留在长江！
花鳗鲡（图片来源：长江中下游土著和外来鱼类）
花鳗鲡（Anguillamar morata）又名溪鳗、雪鳗，在朝鲜、日本、澳大利亚等国均有分布，在我国主要分布于长江下游及其以南省份的河流。花鳗鲡躯体呈圆筒状，后部稍侧扁，总体看来像巨大的鳝鱼，在广东地区被称作“鳝王”。花鳗鲡是降河性洄游鱼类，成熟亲鱼从江河洄游至远洋中产卵繁殖，卵在海流中孵化，孵出的仔鳗经变态为柳叶鳗，随海流漂游到河口近岸，并逐渐变态为白鳗苗（俗称线鳗或玻璃鳗）进入江河中生长、肥育。近年来，由于过度捕捞、水体污染和拦河筑坝阻碍其降河洄游通道等原因，导致花鳗鲡的资源量急剧下降。目前花鳗鲡野生苗种已可进行人工养殖，但人工育苗尚未获得完全成功。
川陕哲罗鲑：为了适应长江现在的生存环境，我一直在努力，人类啊，请别放弃我！
川陕哲罗鲑（图片来源于网络）
川陕哲罗鲑（Hucho bleekeri），又名猫鱼、虎嘉鱼等，在长江主要分布于四川西北部的岷江上游和大渡河上游，是冰川时期残存的冷水性鱼类，在研究动物地理学、鱼类系统发育与气候变化等方面具有很高的科学价值。川陕哲罗鲑最大个体可达50kg左右，背部生有脂鳍，繁殖期为每年3-5月，雄鱼和雌鱼一一配对，具有筑巢行为。上世纪六七十年代，川陕哲罗鲑还是当地的经济鱼类，此后由于过度捕捞、污染和大坝建设等人类活动的干扰，种群数量急剧减少，多个历史分布区已难觅其踪迹。万幸的是，经过科研人员坚持不懈的努力，2013年6月，川陕哲罗鲑在陕西太白县人工繁殖成功。根据2018年10月最新消息，研究人员通过水下视频及科研捕捞，证实陕西太白河中川陕哲罗鲑种群存在自然繁殖，为川陕哲罗鲑野生种群的延续带来了希望。
松江鲈鱼（图片来源：中国淡水鱼类原色图集）
松江鲈鱼（Trachidermus fasciatus）与黄河鲤鱼、松花江鳜鱼、兴凯湖白鱼并称为我国的四大名鱼，主要分布于我国东南沿海及相关河流水域，以上海松江县所产的最为有名。松江鲈鱼外形看起来很像沙塘鳢，亲鱼在繁殖季节头侧鳃盖膜上各有2条桔红色斜带，似4片鳃叶外露，由此得名“四鳃鲈”。松江鲈鱼为降河洄游性鱼类，幼鱼于淡水中育肥，到生殖季节（12-2月）自淡水作降河入海的生殖洄游。松江鲈鱼在上世纪50年代的年捕获量可达万斤。近年来，由于河口污染、掠夺式捕捞和洄游通道阻隔，致使松江鲈鱼野生种群数量不断减少，长江口松江鲈鱼已基本绝迹，目前仅在黄渤海沿岸发现其幸存的种群。2007年山东文登市青龙河下游成立了首个松江鲈鱼自然保护区，并开展松江鲈鱼救治、驯养繁育和放流工作。其后上海松江区水产良种场也从2013年开始进行松江鲈鱼放流，至今在长江口已累计放流约20万尾。
除上述珍稀鱼类以外，长江流域还包括滇池金线鲃（Sinocyclocheilus grahami）、秦岭细鳞鲑（Brachymystaxlenok tsinlingensis）两种国家二级保护动物。其中滇池金线鲃分布于滇池流域的涌泉、溶洞和地下河中，为长江、红河、珠江三大水系分水岭地带；秦岭细鳞鲑分布于秦岭山区的10余条山间溪流中，为长江与黄河的分水岭。与上述物种一样，这些鱼类也都遭受着人类活动干扰导致的栖息地破坏，种群数量稀少，生存受到严重威胁。
