mers病毒最终来源,韩国mers病毒死了多少

首页 > 健康 > 作者:YD1662024-04-18 18:53:09

mers病毒最终来源,韩国mers病毒死了多少(1)

图片来源:新京报网

文 | 郑伟彬

2月18日,美国哥伦比亚大学和哈佛大学研究团队在预印本平台bioRxiv上发表论文《Recombination and convergent evolution led to the emergence of 2019 Wuhan coronavirus》。

该论文指出,通过对病毒基因的研究发现,2019年的新冠病毒最早可能在2009年就通过*,获得了SARS的遗传特征,并在此后通过融合进化成今日的新冠病毒。

新冠病毒是一种此前未被发现的新型RNA冠状病毒。它在核苷酸水平上与SARS病毒具有80%的相似性。

SARS病毒和新冠病毒均属于目前知道的可以感染人类的Sarbecovirus亚属β冠状病毒。该属的其他病毒经常在蝙蝠中出现。

由于病毒种群在新宿主中的能力可以通过快速突变率和*等因素来解释。一般来说,这些因素导致了病毒的高遗传变化性和高进化率,预计每年每个位点(site)有10-4到10-3次替换。

此前针对冠状病毒的全基因组分析估计,冠状病毒的进化速度与其他快速进化的RNA病毒相同;但其中值得注意的是,冠状病毒的刺突基因(Spike gene)进化速度,比同一病毒中其他基因的进化要快。该基因的编码蛋白(Spike,S蛋白)感染机体的关键组分,能够与宿主细胞受体相互作用。

冠状病毒基因*离不开S蛋白

因此,该研究团队尝试通过对新冠病毒的基因进行分析,以确认该病毒的起源以及其进化的方式。

首先,研究团队重点关注*是如何促使β冠状病毒实现在不同的亚属病毒和宿主之间进化。为此,研究团队分析了来自五个主要亚属感染哺乳动物的45个β冠状病毒序列;最终发现,β冠状病毒在跨病毒亚属基因和宿主进行*时,往往涉及S蛋白。

mers病毒最终来源,韩国mers病毒死了多少(2)

图片来源:新京报网

在此基础上,研究团队对MERS(中东呼吸综合征)病毒的*是否也涉及S蛋白进行了近一步研究。

选择MERS病毒进行更深入分析,是因为该病毒是距离目前最近的,能够让人类和动物都受感染的病毒;同时该病毒也已经从人和骆驼的身上,进行了大量的采样。结果发现,MERS病毒也大量涉及S蛋白的*。

新冠病毒是通过*方式产生的

那么新冠病毒的祖先最早的*事件是在什么时候出现的呢?

通过一系列的分析,研究团队在刺突基因中发现能够支持RBD进行潜在*的3个部位。RBD,即受体结合域(receptorbinding domain),它是病毒表面蛋白用来与受体结合的部分。病毒通过它去和人体内细胞上的受体(receptor)结合。

mers病毒最终来源,韩国mers病毒死了多少(3)

图片来源:新京报网

同时,研究还在RBD中发现一个影响到了新冠病毒与人类SARS病毒(humanSARS-CoV)的显著*事件,以及在RaTG13病毒、新冠病毒和人类SARS病毒共享着47个氨基酸,但其与蝙蝠SARS病毒(bat SARS-CoV)的序列并不相同。

由此可以证明,新冠病毒在RBD区域内与人类SARS病毒具有相似的基因类型,并且是通过*方式产生的。

“新冠病毒”产生时间或不晚于2009年

为了追溯该*产生的时间,研究团队通过使用贝叶斯谱系渐进方法(a Bayesian Phylogenetic approach),并与整个基因组谱系进行比较后发现,新冠病毒与RaTG13病毒处于同一进化枝,而人类SARS病毒则在另一个分支上。

mers病毒最终来源,韩国mers病毒死了多少(4)

图说:RBD的时间发展谱系,包括RaTG13病毒、3个新冠病毒序列(红色),6个蝙蝠SARS病毒序列(黑色)和9个人类SARS病毒序列(蓝色)。推论表明至少在11年前(以红色圆点突出显示),甚至是在28年前(蓝色圆点)就进行过一次*的可能情况。

根据上述这些研究结果,该团队提出了两种可能。第一种可能是,新冠病毒源自人类SARS病毒与另外类似SARS的病毒两者间进行的*;第二种可能则至少发生了两种不同的*事件,其中一种导致了人类SARS病毒,另一种产生了这次的新冠病毒。

但不管是哪一种,该团队推断认为,导致产生RaTG13病毒和新冠病毒“共同祖先”的*事件,其时间不迟于2009年就已经发生了。

此外,该研究团队还发现,自该*发生以后,通过RBD区域内出现了大量的替换氨基酸,其中就有40多个具有SARS特征的氨基酸,从而使得这些病毒能够适应人类。

对于这两个过程,该研究团队甚至推断也有可能早在2003年SARS爆发时就已经发生。从那时起,冠状病毒就已经获得了感染人类宿主的能力。

□郑伟彬(新京报智慧城市研究院研究员)

编辑:李碧莹 校对:王心

投稿、合作、联系我们:futurecity@xjbsmartcity.com

栏目热文

文档排行

本站推荐

Copyright © 2018 - 2021 www.yd166.com., All Rights Reserved.