一般来说，菌肥菌剂中的有益菌种主要是细菌、真菌或放射菌，如果菌肥菌剂中所含的有益菌为细菌，那么把菌肥菌剂与防治真菌性病害的农药一起使用是没问题的，同理，如果菌肥菌剂中所含的有益菌为真菌，那么把菌肥菌剂与防治细菌性病害的农药一起使用也是比较安全的；但是，如果在搞不清*菌剂的类型、搞不清菌肥中有益菌的类别时，那么就应当避免把菌肥菌剂与*菌剂药物混合使用，尽量在使用菌肥菌剂后7-10天再使用*菌剂、*虫剂、除草剂等药物，这样可以有效的避免菌肥失效或使用后效果不佳等情况的发生。
除此之外，不少农民朋友也经常会用菌肥或菌剂进行拌种，对此大家应当特别注意的是：凡是已经使用菌肥或菌剂拌过种的种子，就一定不要在使用*菌剂类药物进行拌种，也不可与使用*菌剂拌过种的种子混合在一起使用。
1、把菌肥与未经彻底腐熟发酵的农家粪肥、有机肥一起使用
虽然说，有机肥、农家粪肥中所富含的大量有机质非常有利于菌肥中菌群的繁殖活动，但是这些有机肥和农家粪肥必须是完全发酵腐熟好的，如果把菌肥与未经彻底腐熟发酵的农家粪肥、有机肥等一起混用，那么这些肥料在土壤中会继续发酵腐熟并释放出较多的高温热量，而大多数菌肥中的菌种是不耐高温的种类，这样一来，就会导致菌肥中的有益微生物活性菌被土壤中的高温所*死，进而导致菌肥使用效果不佳或使用后没效果。
2、把菌肥用在土壤酸性过强或碱性过强的地块上
农技小背篓在上面已经给大家说过：菌肥中的有益微生物活性菌在中性或微酸性的土壤环境中才能大量的繁殖、生命力旺盛的活动，而在酸性过大或碱性过大的土壤环境中，菌肥中的有益微生物活性菌就会出现活性大幅降低甚至被强酸强碱环境所*死的情况，这样一来就会导致菌肥失效。
因此，在使用菌肥时，要做到对自家的土壤酸碱度有个大概性的认识，如果自家的土壤酸碱度在6.5-7.5的中性或弱酸性范围内，则使用菌肥效果会比较好，如果土壤的酸碱度过强，那么应当先把过酸或过碱的土壤调到6.5-7.5范围之内，然后再去使用菌肥。
3、把菌肥直接撒施在裸露的土壤表面或在晴天中午高温时使用菌肥
农技小背篓在上面也已经给大家说过：菌肥中有益菌群的繁殖和活动需要适宜的温湿度环境，如果把菌肥直接撒施在田间土壤的地面上，这样一来，菌肥中的有益菌一部分会被阳光中的紫外线直接*死，一部分会因为长时间裸露在外面因高温缺水而死亡，这样使用菌肥的效果基本上和不用菌肥的效果没什么区别。
因此，咱们农民朋友在使用菌肥时，应当避免在晴天中午高温强光时使用菌肥，建议选择清晨或傍晚或阴云天时使用菌肥，而且使用菌肥时一定要在土壤湿润的情况下使用，除了液体菌肥（如菌剂）外，一定要把菌肥施入到田间土壤中10-15公分左右深的作物根际土层中去，这样能够使菌肥中的菌群更好的成活、更快的繁殖，从而取得更好的菌肥使用效果。
