二战时，德国与苏联做交易，三国被德国“卖给”苏联。1939年，苏联依靠强大的武力，和三国签订了友好互助条约。条约规定：苏联有权利在三国拥有海军基地和若干飞机场，“苏联可用自己的经费在上述地区驻扎军队。”经过苏联的“改造”，1940年，三国“自愿”加入苏联。
三国的老百姓并不愿意做苏联人，对于苏联强硬的手段，三国人是非常痛苦的。
苏联有一个在外人看来“很不好”的习惯，占了某地，就要驱逐当地居民，然后迁入大量俄族居民。在1941年，被苏联驱逐的三国百姓，爱沙尼亚有6万，拉脱维亚有3.5万，立陶宛有3.4万。去了哪里呢？寒冷的西伯利亚，实际上就是自生自灭了。
苏联这么做，目的也简单：改变当地的人口结构，以图有力控制这些地区。西伯利亚非常寒冷，被强行迁过去的三国人死亡率较高。苏联还把三国的工厂、设备和机器、粮食和牲口，都拉走的都拉走了。
慑于苏联的强力统治，三国人敢怒不敢言，但仇恨的种子已经种下。火上烧油的是，苏联在五十年代末曾有过反思，对非俄罗斯的其他族群进行道歉，而波罗的海三国居然不在其中，这让他们出离愤怒。这几点，是现在的波罗的海三国对俄罗斯仇恨的主要原因之一。
