伟大的原因2：敢于说出自己的观点
《证类本草》严格摘录其他书籍的内容，并按照时间顺序排列，却对内容没有任何阐述，更没有自己的观点。《本草纲目》却不同，李时珍在书中说出了自己的原则：“复者芟之，阙者辑之，讹者绳之”。意思就是要将重复的删去，缺少的补充，错误的改正。敢于把自己经过分析得到的观点写进去，还介绍了很多自己及父亲治病用药的经验。
挑战权威人士
东晋有名的道家学派高人葛洪，在《抱朴子》中说吃了水银可以成仙，把蜘蛛和其他几种药一起吃了，人就能站在水上不会掉下去。李时珍敢于说出这些内容“不足信”。
不迷信经典
《神农本草经》上将泽泻列为上品，认为长期吃可以让身体轻，能在水上走。陶弘景、苏颂都认同，但李时珍认为 “安有此神功耶？其谬可知”。
狗脊是一种具有镇痛、利尿及强壮功能的蕨类药用植物，古人往往分不清与菝葜、萆薢的来源。李时珍从植物特征分析，认为狗脊 “似大叶蕨，比贯众叶有齿”，与陶弘景所说茎上带刺，叶圆形的百合科植物不同。
伟大的原因3：创新分类方法，解决难题
难题--药物太多，前人的分类方法存在不足，难以参照。
古代大部分本草书籍都是混合使用三品分类法、自然属性分类法和功效分类法。《证类本草》就是这样，把药物按照来源属性分成了 10 部后，由于草类太多，又把草类分为上、中、下三类。对于最末级的药物的排序，主要是按照医生的使用习惯，用得多的排到前面。然而，由于划分的类别较少，难以概括所有的同类药物，导致很多归类不正确，比如雨水和灶心土等被归到了玉石类，蛇、龟等爬行动物被归入了虫鱼类。并且，过去这些方法不管怎么组合，相邻两个药物之间都没有联系。
三品分类法：最早见于《神农本草经》，把药物按照有毒与否，能否久服，分为上、中、下三品。上品，多为补养药，可以长期吃；中品多为驱邪治病，兼有补养作用，有的有毒，有的无毒，斟酌其宜；下品多属攻邪治病之药，毒性较大，多用于急症，不可久服。
自然属性分类法：是按照药物来源属性进行分类，最早见于魏晋时期的《吴普本草》，把药物分为六类。发展至《证类本草》中，人们已总结出了十类自然属性的药物，包括玉石、草、木、人、兽、禽、虫鱼、果、米谷、菜。这显然在药物越来越多时，更有利于查找。
功效分类法：是按照药物主要治疗什么病症进行分类。
《本草纲目》解决难题的办法：
--物以类聚、目随纲举、析族区类
将 1892 种药物归入了 16 部 60 类中，分类远多于《证类本草》中的 10 部 30 类。比如数量较多的草部，分为了山草、芳草、湿草、毒草等 10 类，人们容易从类别名称就可以大致了解药物的生长特性，比如芳草就是指具有芳香气味的本草。
除了更多的分类，顺序的变化更是创举，从无机物到有机物，从植物到动物，从低等动物最终到高等动物 “人” ，这一顺序和近现代的生物分类方法不谋而合。
水、火、土、金石——无机物
草、谷、菜、果、木——植物
虫、鳞、介、禽、兽、人——动物
在最末级的药物排序处理上，李时珍开创性的提出了 “析族区类” 的分类原则，按照他认为具有相似属性的物种放到一起，比如将菊花、艾叶和青蒿排列在相近的位置，将同样会流出汁液的大戟、泽漆、甘遂和续随子排到一起，经过现代植物分类学证实，这些都是属于亲缘关系相近的植物。这一创举不仅为《本草纲目》内容的查找提供了方便，其前卫的自然分类方法，比西方植物学家林奈的自然分类法早出了 200 余年，对后世的科学研究产生了深远的影响。
伟大的原因4：推动了其他学科的发展
植物学研究：《本草纲目》记载了 1000 余种植物，不仅收集了前人的记载,还记录采集标本，对植物的产地、生境、生长发育特征、栽培、采收的方法等内容，为后人植物学研究提供了丰富的资料。
动物学研究：《本草纲目》记载了 400 余种动物，描述了许多动物的形态、生理特征、繁殖情况及病症等，对我国乃至世界的动物学研究做出了巨大贡献。
矿物学：《本草纲目》记载矿物类药物 100 余种，记载了这些药物的产地、种类、特性、理化性质、开采、冶炼提炼方法、性味、功效等。并且还记载了重要金属矿产的分布地域以及找矿的方法，为矿物学研究提供了宝贵的资料。
当然除了在以上自然科学界的贡献，如同前面介绍的，在化学、物理学等方面也是贡献突出。
文化贡献：《本草纲目》说明药物产地、性味、主治的特点，经常引用名家诗文，记载了我国古代咏药诗的文化特色。另外，书中还记载了大量民俗、宗教等文化内容。为后人研究古代文化提供了丰富的资料。
李时珍以《本草纲目》这部巨著为人类做出了伟大的贡献，深受后世尊敬，被后人称作 “医中之圣”。人们对《本草纲目》的研究至今还在进行。
荷花 Nelumbo nucifera
（信息来源：中国野生植物保护协会公众号 编辑 王强）
