目前,冠状病毒分为α、β、γ和δ四属冠状病毒。其中β属冠状病毒分为A、B、C、D个亚属。在已知冠状病毒中有α属的 HCoV-229E、HCoC-NL63、VHCoV-OC43、HCoV-HKU1和β属的SARS-CoV、中东呼吸综合征(MERS-CoV)及SARS-CoV-2均可感染人类,但是α属的危险性明显小于β属。
图 冠状病毒分类
注:来自https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1
SARS-CoV与SARS-CoV-2同属于β属冠状病毒,通过文献研究分析两者间的相关性有六方面:
① 从病毒分类角度看,SARS-CoV和SARS-CoV-2同属于冠状病毒科、冠状病毒亚科、β冠状病毒属、类SARS病毒种;
② SARS-CoV-2与两种来源于蝙蝠的SARS有较大相似关系,其相似度为88%,SARS-CoV和SARS-CoV-2两者全基因组水平相似度为79%;
③ 用于病毒鉴别的7个保守域与SARS-CoV的氨基酸高达94%的相似度;
④ SARS-CoV可通过细胞膜表面的血管紧张素转移酶2(ACE2)受体进入细胞,通过S蛋白与宿主的受体结合而达到感染的目的,SARS-CoV-2也具有相同进入细胞的途径;
⑤ SAR S-CoV-2的S蛋白与人的ACE2受体的亲和力更高,相当于SAR S-CoV的10~20倍,故其传播性更强;
⑥ 二者的ACE2受体在β冠状病毒属中为唯一的一对。
由此可见,两者在来源上密切相关,极度相似。
从2002年SARS开始,果子狸和蝙蝠先后被认为是最主要的动物宿主。因为果子狸常年捕食菊头蝠,所以导致身体携带SARS-CoV。后来大量证据表明,菊头蝠是SARS-CoV的宿主。自此,真凶菊头蝠浮出水面。而对于SARS-CoV-2,其进化邻居和外类群都在各类蝙蝠中有发现,故认为该病毒的原始自然宿主可能是蝙蝠。研究发现,SARS-CoV-2与蝙蝠身上的病毒相似度达90%左右,但这种相似度不足以支持该病毒是直接由蝙蝠传染,故查找中间宿主成为关键。