在电影中，Josh的父亲Hal负责接他放学。Hal是个聪明的电脑高手，但他处在失业状态。“他总是声称自己即将发现一些伟大的事情。”剧本大纲写道。Hal刚刚做了一台人工智能计算机，会使用一种被他称为XRI（极端激进智能，eXtremely Radical Intelligence）的全息记忆系统。晚饭过后，Hal出门买东西，叮嘱Josh不要碰XRI。
虽然嘴上说不，但Josh当然会碰它啦！Josh进入了计算机，要求XRI帮他完成那篇关于试飞员索尼克的作文。XRI不知道索尼克是谁，于是Josh打开世嘉土星玩《音速小子索尼克》，向它展示索尼克的样子。
剧本大纲写道：“就在这时候，奇怪的事情开始发生了。索尼克不再对游戏手柄做出响应，它发现了自己的意识。”Jeffries告诉我：“刺猬索尼克从右门走出来，进入现实世界，这也让它成了游戏世界的叛徒。”索尼克和Josh在初次见面后成为了朋友。而剧本大纲对索尼克的描述是“现实世界中的一个3D CG角色”。
Jeffries解释了他为什么想要在一部真人电影里使用3D动画。“这种做法在当时并不常见，但我跟几位从事视觉特效工作的朋友聊了聊，找到了一种让它变得更有可行性的办法。随着时间推移，将CG角色融入现实世界变得越来越普遍了。”
由于无法控制自己的好奇心，索尼克很快破坏了整间公寓，而在一片混乱之中，蛋头博士（Doctor Robotnik）也从游戏里逃了出来。“为了逃离游戏世界，他等了很多年。”剧本大纲写道，“他召唤宇宙飞船，冲出公寓，带着疯狂的热情逃到了现实世界。”Jeffries补充说：“按照故事的主题框架，Boss也知道怎样利用游戏故障进入现实世界，并且会带着他的追随者们和CG角色对现实世界造成严重破坏。”
索尼克试图追踪蛋头博士，但现实世界却分散了他的注意力。当索尼克跳到屋顶上时，烟囱会断裂，撞到灯柱时他会受伤。索尼克在马路上奔跑，却造成了交通混乱；他想要吸引一个女孩，但对方却被他吓得惊声尖叫。“现实世界还没有为一只蓝色刺猬在马路上奔跑做好准备。”剧本大纲写道。不过索尼克也发现，他在现实世界停留的时间越长，就会变得越虚弱。
当Hal回到家，他发现自己的公寓一片狼藉，XRI也已被毁。Josh谎称家里遭了窃贼。Josh的母亲Lisa也来了，与Hal又一次爆发争吵，然后她将Josh带回自己家中。
当天夜里，索尼克找到Josh并叫醒了他。索尼克告诉Josh自己身体虚弱，已经疲惫不堪——虽然索尼克对游戏世界了如指掌，但现实世界对他来说太陌生了。索尼克需要补充能量，所以他需要混沌翡翠（Chaos Emeralds）。Josh和索尼克决定合作，发现现实世界中也有混沌翡翠，就藏在看上去普普通通的岩石中。
“你只要知道应当粉碎哪些岩石。”剧本大纲写道。这对伙伴找到了第一块混沌翡翠，索尼克使用它回复了能量。Josh也想试试，于是索尼克让他体验了一下超能力——Josh使用超能力在30秒钟写完了整个学期的作文！Josh想得到更多超能力，不过索尼克告诫他在熟练掌握超能力之前不要使用。
与此同时，蛋头博士占领了小镇上一座废弃的游乐园，并计划借助混沌翡翠的力量来统治现实世界。蛋头博士招揽了一群校园混混，提供电脑身体组件，让他们变成了霸凌机器人。他们开始在游乐园掘地三尺，打碎每一块岩石，寻找极其罕见的混沌翡翠。
在剧本的第二幕中，索尼克和Josh以霸凌机器人为线索，发现了蛋头博士的位置。Josh的父亲Hal在Shady Corporation找了一份新工作，但索尼克躲在Hal的汽车后备箱，发现蛋头博士是那家公司的老板——蛋头博士决定重新开放游乐园，他Hal使用XRI来创造一个虚拟现实游乐设施。
蛋头博士的游乐园收获了巨大成功，这主要是因为游乐园向孩子们免费开放，所有糖果和冰淇淋也免费。在游乐园外，准备入园游玩的孩子们排成了长队。但索尼克和Josh在游乐园里四处窥探，发现蛋头博士借助虚拟现实游乐设施和Hal的XRI技术，用克隆机器人替代了那些孩子。
“真正的孩子们正在城里挖地，打碎岩石，目的是找到万分之一的混沌翡翠。”Jeffries写道，“克隆机器人跟着他们的父母回家了。”
索尼克和Josh发现，蛋头博士的计划是利用混沌翡翠的力量驱动XRI，让亚马逊热带雨林、珠穆朗玛峰等世界自然奇观数字化并在VR环境下重现，并向游客收取巨额费用。“索尼克和Josh傻眼了，他们必须阻止这个邪恶的计划。”Josh很害怕，但索尼克告诉他，“为了自己所信仰的东西”，他必须挺身而出。
在Jeffries的设想中，电影里会有一段霸凌机器人追捕索尼克和Josh的场景，为了帮助Josh逃走，索尼克使用了自己的所有能量。索尼克被抓了，Josh试图告诉父母关于蛋头博士、克隆机器人、XRI和索尼克的真相，但他们当然不信……在小镇上，被家长们带回家的克隆机器人小孩都很听话。“克隆小孩对家长们唯命是从：吃豌豆、打扫房间、做家庭作业。”剧本大纲写道，“Josh对那些小孩感到害怕，因为他知道他们是蛋头博士的邪恶产物。如果蛋头博士让一切都变得机械化，那么这个世界就太可怕了！”
在剧本的第三幕中，Josh想到了一个让蛋头博士回到游戏世界的计划。根据Jeffries的描述，“计划是用索尼克做饵，引诱Boss回到游戏世界。但在故事的第三部分，孩子们也被吸进了游戏世界。”索尼克、Josh和蛋头博士进行了一场对决，正义的一方最终获胜。
剧本大纲写道：“Hal、Lisa和Josh穿过漩涡，回到了现实世界。但悲伤的一幕是索尼克决定留在游戏世界，他不得不警惕蛋头博士的邪恶计划，毕竟，那是他的工作。”
这段冒险让Josh一家人的关系变得更紧密，但Hal认为XRI技术太危险，决定永远不再使用。“Josh承诺（不会再使用它）……就在不远处的一台电视机屏幕内，索尼克朝他眨了眨眼，然后继续自己在游戏里的冒险。”Jeffries说，“这是一次重大的分离时刻，他们和索尼克成了朋友，但都不得不回到自己的世界。”
