神机营自从被组建以来，就是以禁卫军的形式被安排在京城周围以及三海地区，并非是作为正规军来培养的，
这也就直接导致了神机营无法参与那种大规模作战，无法像曾国藩左宗棠他们的淮军一样积累雄厚的实战经验。
但是在地方上爆发战争的时候，神机营中的部分军队也会跟随其他部队一同前往进行战斗。例如神机营就曾参与过平定游荡于陕、晋、直地区的捻军起义；
左宗棠出征新疆的时候，神机营也派出了部分军队随行征战。
在俄罗斯对蒙古进行军事压制的时候，神机营也有部分军队被派往乌里雅苏台以及库伦等地方进行军事指导。
可以说，清政府已经将神机营当做了一支“无事拱卫京师，有事资以制敌”的部队，并不直接出征参与军事战斗。
这直接导致神机营中并没有什么军旅气息，慢慢的被八旗军队原来的陋习所侵蚀。
没有实战经验的他们也逐渐失去了他们应有的强大战斗力，直接使他们在战斗上无法战略御敌，致使了清政府神机营这一战略决策产物的“*”。
列强前不堪一击，神机营退出历史由于经常没有战争的派遣，原先被视为精锐的神机营也逐渐与清朝入关以后的八旗军队一样染上了许多陋习，许多神机营中的将士都有吸食鸦片以及遛鸟的恶习，没有丝毫的战心。
其次，由于神机营是清政府的重点发展对象，因此神机营中的将士待遇十分优厚，再加上他们平常没有战争，
因此神机营就成了那些达官贵人后代寄居的地方，许多官二代就这样通过关系进入了神机营，但是平常也不会进行训练。
甚至到了神机营后期时，许多神机营中的将士会让外面的闲杂人等代替自己在营中值班，自己则在外面吃喝玩乐。
这群人拿着国家给的优厚的战略资金，却成为了他们吃喝玩乐的资本。
醇亲王奉命检阅神机营军队的时候，甚至出现了“士弱马疲，步伐错乱”的现象，许多人连最基本的军容操练都不会。
左宗棠奉朝廷的命令训练神机营的时候，由于其治军较严，引起了许多将士的不满。
左宗棠评价说，倘若要让他们上战场的话还要进行长时间的训练，可见左宗棠说话已经是十分含蓄了，
此时的神机营俨然已经成为了一支十分羸弱的军队，与清朝想要实现的目标已经是渐行渐远了。
以至于后世有人评价说，神机营对于清朝来说已经不是什么可以在危急时刻拯救朝廷于水火的神兵利器了，
说到底就是朝廷的蛀虫，一点点蚕食着清政府的军费财政却又不能发挥什么作用。
公元1900年的时候，八国联军侵华战争爆发，这一战也成为了神机营的灭亡之战。
在八国联军的进攻之下，北京城也是危在旦夕，原本用来供佑京师的神机营面对八国联军的时候没有展现出丝毫一个国家精锐军队该有的表现，
在与义和团的配合作战之下如鸟兽般溃败，甚至出现了许多逃兵。
