第一、环境挑战，首先在海上建立大桥的时候，大风，水的深度，海浪，潮汐等因素较多，当然这都是环境方面的重要问题，这也算是对桥梁建设的一个抗压性建设，在建设大桥的时候，气候环境“风云突变”，上一秒是太阳，下一秒可能就是降雨，所以这不仅给建设带来了难度，还对施工的人员来说是一个挑战。
福建属于典型的亚热带海洋性季风气候，雨量充沛，光照充足，所以这就是我们上面说的“气候风云突变”原因，年平均气温17～21℃，这算是不冷不热，平潭岛现为全省第一大岛，如今也开通了公路，铁路的链接，是非常好的消息。
第二、施工挑战，施工的时候，上面也说了环境就是一个挑战，这个挑战可以说是难上加难，所以在进行桥塔建设的时候，都是采取的全封闭防风液压爬模抗风、1100千牛/米的塔吊及塔吊附墙抗风、空间桁架横撑等施工技术，当然自主研制了吊高110米、吊重3600吨的巨型浮吊船也在这次建设之中提供了非常大的帮助，利用先焊接，拼装好之后，采取架梁吊机或3600吨浮吊整节段海上架设。并不是大家说的一点一点的直接在海上架设，所以这个创新很好，改变了耗时，难度大的问题，所以这种方案是择优方案。
第三，除了这些挑战性的难度之外，当然创新的技术也还有其他的，我们就列举一下——例如：“可视化仿真”BIM技术、“双孔连做”节段拼装造桥技术等等，这些都是技术创新。自主研制了大型液压动力头钻机，可一次成孔5米直径钻孔桩，成功施作了世界上桩径最大的桥梁工程桩，所以建设一座跨海公铁大桥并不那么容易，虽然很多技术可以融合陆地桥梁的技术，但是海上建设更加难，考虑的因素更多，这下知道平潭海峡公铁大桥建设的难度多大了吧。
除了我们上面说的，是中国第一座真正意义上的公铁两用跨海大桥，完成平潭岛不通铁路的历史之外，这还将整个平潭岛与内陆进行了连通，推动了内陆到平潭岛的快速经济圈，根据初步的评估显示，未来从我国内陆城市武汉，坐动车到平潭岛，最快可以6个多小时到达，这比之前节省了近10多个小时，所以非常令人惊讶，大家可以在1天的时间内，完全两地的走动。
