运河就在这段埃及历史上的多事之秋被逐渐荒废，直到与赫梯的战争结束后法老拉美西斯二世才又重启运河工程。然而海上民族的入侵再次使埃及文明陷入衰退的境地。公元前595年尼科二世去世后运河工程被继任法老忘得一干二净，于是古埃及的法老运河工程就这样被无限期搁置下去了。后来波斯帝国、希腊化的托勒密王朝乃至阿拉伯帝国在统治埃及时期都开通过连接红海与地中海的运河。
今天的苏伊士运河是在1859年正式开工、在1869年建成通航的。当时这一工程所面临的困难除了许多意想不到的政治和技术问题之外就是天量的造价：高达1860万镑的造价超过了最初预算的两倍多。工程完工后河面宽度在280米至345米之间。这样的宽度并排放两艘货轮是没有问题的，但如果编队航行的话就存在很大隐患，不过这样的宽度在当时的运量条件下其实并不算窄。
问题在于苏伊士运河通航后的150多年里运量呈几何级数在膨胀，然而与此同时苏伊士运河的宽度在过去的150多年里几乎就没太大的变化。苏伊士运河尽管是一条对国际贸易意义重大的运河，然而作为运河所有者的埃及却有着自己的算盘。没人会做亏本的生意：埃及不可能大公无私为国际社会做贡献，埃及是否拓宽运河取决于他们自己是否觉得合算。他们觉得合算就拓宽，如果觉得不合算就不动手。
在1858年法国人启动了关于苏伊士运河的计划，然而法国人在实际施工过程中很快发现这一工程的开支是巨大的。普法战争后法国迫切需要和英、俄结成反德联盟，于是法国在埃及问题上主动向英国妥协：不仅将自己控制的苏伊士运河公司的股份全部转让给英国，而且默认英国吞并埃及。包括苏伊士运河在内的整个埃及就此沦为英国殖民地。一战后英国允许埃及独立，但仍保留在运河区驻兵的权利。
