游戏的故事从河谷村开始，一个名叫艾萨克（Isaac）的小男孩被他的母亲叫醒，外面肆虐的风暴即将发生雪崩，需要立刻转移到安全的地方，艾萨克与他的朋友加雷特（Garet）和珍娜（Jenna）见面，众人一起帮忙救出了珍娜的兄弟菲利克斯（Felix），但是在返回的时候一块巨石掉落压塌了房子，菲利克斯、艾萨克的父亲、珍娜的双亲不幸遇难。
三年之后艾萨克等人与学者克拉登（Kraden）正在进行研究，他们偶然发现了元素星，却遭到了神秘势力入侵，他们夺走了星星并绑架了珍娜和克拉登，艾萨克和加雷特被人所救，开始了寻找同伴和事件真相的冒险旅程。
本作在传统2D日式RPG的基础上进行了大胆改良，前面提到制作人试图将魔法贯穿到整个游戏体验中，而实际效果确实令人眼前一亮，《黄金太阳》创造出全新概念Psynergy，可以理解为Physics（物理）和Energy（能量）混合体，除了像传统作品那样在战斗中造成伤害，以及给敌我双方提供正面负面状态效果之外，还可以在场景地图中使用，例如移动石柱解决谜题、利用风吹清理堆积的树叶、冻结水形成临时的冰块等，让玩家有强烈的探索*，尝试在不同的环境中体验“给这里来个XX魔法会咋样”，成就感十足。
游戏中还包含了生物收集玩法，这也是当时GBA作品中经常见到的，《黄金太阳》设计了种类丰富的精灵（Djinn），这是有着强大元素力量的灵魂，附加到角色身上时会提升能力属性，以及多种特殊效果，后期甚至可以召唤强大的生物，可以给敌人造成巨大伤害。所有的精灵分成地属性的金星（Venus）、风属性的木星（Jupiter）、火属性的火星（Mars）、水属性的水星（Mercury）四大类，这些精灵会在在野外、城镇或地牢中遇到，不过通常需要战斗才能获取。
不同属性的精灵根据其能力效果还分成四个等级，就像收集宝物的星级一样，精灵也是整个游戏职业系统的核心，玩家选择不同的职业将获得对应的技能组合，而职业则取决于装备精灵的属性等级。
玩家之间通过连线对战，这是任天堂在GBA掌机推广的重要功能，本作也不例外，通过专用线缆将两台设备连起来，就可以在游戏菜单中选择对战模式，选择喜欢的角色和对手较量。此外游戏还包括了竞技场模式，玩家可以读取故事模式的存档载入战斗队伍，进入强敌环绕的竞技场一决高下，这里有着对战斗技巧最严苛的考验。
《黄金太阳》发售后取得176万套销量，其中日本地区40万套，游戏获得了众多玩家好评，生动的图形、高品质的声音、多样精致的玩法令人印象深刻，尤其是以精灵为核心的战斗和养成系统。IGN给出了9.7分极高评价，GameSpot则称本作是“SFC经典元素集大成者”，任天堂官方杂志《任天堂力量》（Nintendo Power）将《黄金太阳》评选为2001年最佳GBA游戏。
