根据公开的信息99A主战坦克的正面装甲可抵御美军M1A2坦克M256滑膛炮或德国豹2A6坦克加长版55倍径120mm炮发射的M829A4和DM53/63贫铀穿甲弹的攻击,炮塔的侧面储栏中加装了单侧14块的附加装甲,进一步提升炮塔的防御水平,几乎目前的反坦克武器例如标枪导弹、长钉式导弹等第三代反坦克导弹都可以防御。
除了这些装甲之外,还在炮塔后部设计了一部新型的高能量激光压制系统,这款激光发射器可以水平旋转360度,俯仰-12~ 90度,水平追踪角速度45度/秒俯仰速率40度/秒。
此设备激光输出能量为1000兆焦耳,脉冲回复频率10次/秒,最大作用距离4000米,最小作用距离200米,可连续工作30分钟,能干扰敌方来袭反坦克导弹,烧毁敌方坦克的瞄准器或使敌方步兵致盲,并且还可以用于反坦克武装直升机的防御,这在国际坦克市场是绝无仅有的。
99A主战坦克战斗全重为55吨,想要驱动这款钢铁战甲就需要比较出色的动力系统,早期的动力采用的是150HB-1柴油发动机,这款引擎最大输出功率为1200匹马力,升级的99A版本换成了能输出1500匹马力的150HB-2型水冷V12双涡轮增压发动机。