1685年，都统彭春统帅了一支由满、汉、蒙古、达斡尔等官兵组成的三千人的军队从瑷珲出发，到达雅克萨城下。
本着先礼后兵的原则，彭春先是向沙俄发出最后通牒，劝说来犯之敌撤出雅克萨。
但是俄国的督军托尔布津则傲慢无礼，认为雅克萨城坚固，城内有众多哥萨克士兵，还有各种武器。一口回绝了清军的告诫，要和清军一战决胜负。
清军在彭春率领下，水路列阵，用炮火猛烈轰击雅克萨城。双方鏖战整个一个夜晚，侵略者损失惨重。
天要亮的时候，彭春在雅克萨城下堆满柴草，要用火攻之计。托尔布津这时候，就玩弄了光棍不吃眼前亏的招数，假装投降。
彭春等根据康熙实现的命令，允许托尔布津退回到尼布楚。这次清政府体现出了过于大度：雅克萨城的侵略者可以带走所有物资和武器，这也太宽大了。
700多名雅克萨士兵撤走，甚至感动了其中的40多名沙俄士兵，要求永远留在中国。清军将领犯了错误，没有在雅克萨驻防和防守。仅仅是下令把雅克萨城焚毁，然后班师回到了瑷珲。
两个月后，托尔布津卷土重来，率领一千多人，十二门火炮。清军这次的雅克萨之战，将领是萨布素。萨布素率领清军实行包围和坚壁清野的政策，也就是围困。
在围困至于，还炮击雅克萨，托尔布津也死去。半年后的冬天到来，俄军弹尽粮绝，流行坏血病。城中就剩下66个俄国士兵。
这时候，俄国特使到北京和康熙谈判。康熙再次体现出了大度：给雅克萨城的雅克萨送去了粮食，甚至派医生给重病的沙俄士兵看病。这可能是康熙深受儒家仁义思想的影响。
1687年，中俄两国开始谈判。这时候俄国的统治者是彼得大帝，15岁。俄国正在和土耳其争夺黑海控制权，在和土耳其的战争中，沙俄战败。
沙俄这时候无力顾及遥远的西伯利亚和中国的东北。沙俄和土耳其的战争让沙俄焦头烂额了。
清政府对这一切都不知晓。清政府不清楚这是谈判的极好的筹码。在谈判中吃了亏。
为什么在胜利的情况下还吃了会亏？
